CAJ | 학술논문

痢疾杆菌全基因组序列及基因组岛的分析
이질간균전기인조서렬급기인조도적분석
Complete Genome Sequence of Shigella flexneri 2a 301 Strain and Analysis of "Shigella-islands"

万方数据

中国工程科学中國工程科學 중국공정과학
ENGINEERING SCIENCE
2002年 10期 40-47 ,共8页

刘红%杨帆%张笑冰%张继瑜%杨国威%董杰%薛颖%侯云德%袁正宏%闻玉梅%徐建国%陈洪松%马大龙%王宇%杨剑%沈岩%强伯勤%吴洪涛%贺秉坤%吕渭川%金奇

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福氏2a志贺菌301株%全基因组序列测定%痢疾岛%毒力岛福氏2a誌賀菌301株%全基因組序列測定%痢疾島%毒力島
복씨2a지하균301주%전기인조서렬측정%이질도%독력도

福氏2a志贺菌(Shigella flexneri serotype 2a)是引起人类细菌性痢疾的主要病原体.本文在国际上首次完成了福氏2a志贺菌301株(Sf301)(我国细菌性痢疾的优势流行株)的全基因组核苷酸序列测定和初步分析.该基因组包括一条由4 607 203个碱基对(bp)组成的环状染色体和一个含221 618 bp的侵袭性大质粒pCP301以及另外两个小质粒.通过将Sf301的染色体序列与其亲源关系相近的非致病性大肠杆菌K-12菌株MG1655进行比较基因组学研究,发现Sf301的染色体上有572 Kb特异性序列,并形成了320个长度大于50 bp的"痢疾岛"(Shigella-island,SIs),其中大于1 Kb的共计131个.这些岛共包含519个开放读码框架(OpenReading Frames,ORFs),多数SIs的一侧或两侧均伴有插入序列元件、转座子或者tRNAs.G+C含量及密码子使用频率等分析显示出部分SIs的外源性.通过结构及ORF编码产物功能的分析,鉴别出9个可能与痢疾杆菌致病性有关的"毒力岛",其中7个可能的毒力岛为首次发现.
복씨2a지하균(Shigella flexneri serotype 2a)시인기인류세균성이질적주요병원체.본문재국제상수차완성료복씨2a지하균301주(Sf301)(아국세균성이질적우세류행주)적전기인조핵감산서렬측정화초보분석.해기인조포괄일조유4 607 203개감기대(bp)조성적배상염색체화일개함221 618 bp적침습성대질립pCP301이급령외량개소질립.통과장Sf301적염색체서렬여기친원관계상근적비치병성대장간균K-12균주MG1655진행비교기인조학연구,발현Sf301적염색체상유572 Kb특이성서렬,병형성료320개장도대우50 bp적"이질도"(Shigella-island,SIs),기중대우1 Kb적공계131개.저사도공포함519개개방독마광가(OpenReading Frames,ORFs),다수SIs적일측혹량측균반유삽입서렬원건、전좌자혹자tRNAs.G+C함량급밀마자사용빈솔등분석현시출부분SIs적외원성.통과결구급ORF편마산물공능적분석,감별출9개가능여이질간균치병성유관적"독력도",기중7개가능적독력도위수차발현.