分子植物育种
分子植物育種
분자식물육충
MOLECULAR PLANT BREEDING
2012年
3期
363-370
,共8页
花生%转录因子%in silico分析
花生%轉錄因子%in silico分析
화생%전록인자%in silico분석
本研究利用电子克隆的方法获得花生转录因子WRI1的cDNA序列(AhWRI1),采用生物信息学方法,预测和分析AhWRI1的序列特点、编码蛋白AhWRI1的特性以及与其他植物氨基酸序列的相似性.结果表明:AhWRI1含一个长度为780 bp的完整开放阅读框架,编码259个氨基酸.编码蛋白AhWRI1包含2个典型的AP2功能域,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥和油菜的WRI1相似.AhWRI1与拟南芥、油菜WRI1氨基酸保守序列同源性在81.87％～100％之间.AhWRI1无序化程度为71.8％,比拟南芥低3.8％,比油菜高2.5％.亚细胞定位显示AhWRI1在细胞核内,并预测该蛋白具有转录复制,调控及转录与结合的可能性分别为0.244、0.226和0.152.研究结果为花生WRI1基因的分子克隆,功能鉴定提供理论基础.
本研究利用電子剋隆的方法穫得花生轉錄因子WRI1的cDNA序列(AhWRI1),採用生物信息學方法,預測和分析AhWRI1的序列特點、編碼蛋白AhWRI1的特性以及與其他植物氨基痠序列的相似性.結果錶明:AhWRI1含一箇長度為780 bp的完整開放閱讀框架,編碼259箇氨基痠.編碼蛋白AhWRI1包含2箇典型的AP2功能域,是親水性蛋白,在蛋白質的三級結構上與擬南芥和油菜的WRI1相似.AhWRI1與擬南芥、油菜WRI1氨基痠保守序列同源性在81.87％～100％之間.AhWRI1無序化程度為71.8％,比擬南芥低3.8％,比油菜高2.5％.亞細胞定位顯示AhWRI1在細胞覈內,併預測該蛋白具有轉錄複製,調控及轉錄與結閤的可能性分彆為0.244、0.226和0.152.研究結果為花生WRI1基因的分子剋隆,功能鑒定提供理論基礎.
본연구이용전자극륭적방법획득화생전록인자WRI1적cDNA서렬(AhWRI1),채용생물신식학방법,예측화분석AhWRI1적서렬특점、편마단백AhWRI1적특성이급여기타식물안기산서렬적상사성.결과표명:AhWRI1함일개장도위780 bp적완정개방열독광가,편마259개안기산.편마단백AhWRI1포함2개전형적AP2공능역,시친수성단백,재단백질적삼급결구상여의남개화유채적WRI1상사.AhWRI1여의남개、유채WRI1안기산보수서렬동원성재81.87％～100％지간.AhWRI1무서화정도위71.8％,비의남개저3.8％,비유채고2.5％.아세포정위현시AhWRI1재세포핵내,병예측해단백구유전록복제,조공급전록여결합적가능성분별위0.244、0.226화0.152.연구결과위화생WRI1기인적분자극륭,공능감정제공이론기출.
