畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2009年
8期
1157-1163
,共7页
高智晟%杨龙%张冬杰%刘娣
高智晟%楊龍%張鼕傑%劉娣
고지성%양룡%장동걸%류제
猪%MEF2a%克隆%Real-time PCR
豬%MEF2a%剋隆%Real-time PCR
저%MEF2a%극륭%Real-time PCR
为了进一步了解猪MEF2a基阒的结构与功能,本研究采用生物信息学结合RT-PCR的方法,克隆了猪的MEF2a基因,获得了它的2个变异体序列.结果表明,猪MEF2a variant 1基因cDNA长1 524 bp(EF576923),编码508个氨基酸,分子量为54.481 ku;variant 2基因cDNA长1 416 bp(EF576922),编码471个氨基酸,分子量为50.846 ku.MEF2a两个变异体的氨基酸序列同源性为86.79%,第1aa~77aa和第132aa~470aa完全一致,第78aa~131aa是高变区,variant2与variant1相比,在第224aa~258aa处存在34个氨基酸(102 bp)的,缺失.利用Real-time PCR方法检测了MEF2a的表达.结果表明,MEF2a mRNA是一个广谱表达基因,在心、肝、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、背肌和腿肌中都能检测到,在腿肌中优势表达.MEF2a variant1与马和家鼠构成一个小类群,而variant 2与牛和人构成了另外一个小类群,推测MEF2a基因在进化过程中发生了较为明显的变异.
為瞭進一步瞭解豬MEF2a基闃的結構與功能,本研究採用生物信息學結閤RT-PCR的方法,剋隆瞭豬的MEF2a基因,穫得瞭它的2箇變異體序列.結果錶明,豬MEF2a variant 1基因cDNA長1 524 bp(EF576923),編碼508箇氨基痠,分子量為54.481 ku;variant 2基因cDNA長1 416 bp(EF576922),編碼471箇氨基痠,分子量為50.846 ku.MEF2a兩箇變異體的氨基痠序列同源性為86.79%,第1aa~77aa和第132aa~470aa完全一緻,第78aa~131aa是高變區,variant2與variant1相比,在第224aa~258aa處存在34箇氨基痠(102 bp)的,缺失.利用Real-time PCR方法檢測瞭MEF2a的錶達.結果錶明,MEF2a mRNA是一箇廣譜錶達基因,在心、肝、胃、脾、腎、肺、大腸、小腸、揹肌和腿肌中都能檢測到,在腿肌中優勢錶達.MEF2a variant1與馬和傢鼠構成一箇小類群,而variant 2與牛和人構成瞭另外一箇小類群,推測MEF2a基因在進化過程中髮生瞭較為明顯的變異.
위료진일보료해저MEF2a기격적결구여공능,본연구채용생물신식학결합RT-PCR적방법,극륭료저적MEF2a기인,획득료타적2개변이체서렬.결과표명,저MEF2a variant 1기인cDNA장1 524 bp(EF576923),편마508개안기산,분자량위54.481 ku;variant 2기인cDNA장1 416 bp(EF576922),편마471개안기산,분자량위50.846 ku.MEF2a량개변이체적안기산서렬동원성위86.79%,제1aa~77aa화제132aa~470aa완전일치,제78aa~131aa시고변구,variant2여variant1상비,재제224aa~258aa처존재34개안기산(102 bp)적,결실.이용Real-time PCR방법검측료MEF2a적표체.결과표명,MEF2a mRNA시일개엄보표체기인,재심、간、위、비、신、폐、대장、소장、배기화퇴기중도능검측도,재퇴기중우세표체.MEF2a variant1여마화가서구성일개소류군,이variant 2여우화인구성료령외일개소류군,추측MEF2a기인재진화과정중발생료교위명현적변이.