实验动物与比较医学
實驗動物與比較醫學
실험동물여비교의학
LABORATORY ANIMAL AND COMPARATIVE MEDICINE
2008年
5期
299-303
,共5页
谢建云%冯洁%柏熊%胡建华%高诚
謝建雲%馮潔%柏熊%鬍建華%高誠
사건운%풍길%백웅%호건화%고성
东方田鼠%线粒体DNA(mtDNA)D-loop区%遗传多态性
東方田鼠%線粒體DNA(mtDNA)D-loop區%遺傳多態性
동방전서%선립체DNA(mtDNA)D-loop구%유전다태성
目的 探讨我国不同地区东方田鼠线粒体DNA D-loop多态性.方法 对四个种群东方田鼠线粒体DNA(mt DNA)D-loop片段进行测序,并对测序结果用Clustal W软件进行比对,通过MEGA Version3.1软件构建基于平均遗传距离的NJ(neighbor-joining,邻接法)分子系统进化树,用Dnasp4.0分析所有序列的多态位点、核苷酸多样性、单倍型数目、单倍型多样性以及进行Tajima's中性显著性检验.结果 四个种群34个东方田鼠个体的mtDNA D-loop区全序列共发现19个单倍型,单倍型比例为55.88%,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.934±0.024和0.04334±0.00285.以台湾田鼠(Microtus kikuchii)线粒体全序列(GenBank登录号AF348082)为对照,共检测到核苷酸变异位点172个,约占核苷酸总教的18.66%.由分子系统进化树可发现所有34只东方田鼠分为两大类,小体型黑龙江东方田鼠为一类,其他三个种群东方田鼠为另外一类,在这一类别中,又有两个分支,其中所有宁夏种群鼠及3只大体型黑龙江种群鼠为一个分支,所有洞庭湖种群鼠和其他5只大体型黑龙江种群鼠为另一个分支.结论 我国东方田鼠在mt DNA D-loop片段存在种内遗传多态性,种群内和种群间都存在一定的遗传变异,并且黑龙江小体型种群东方田鼠表现出与其他三种群东方田鼠更大的差异水平.
目的 探討我國不同地區東方田鼠線粒體DNA D-loop多態性.方法 對四箇種群東方田鼠線粒體DNA(mt DNA)D-loop片段進行測序,併對測序結果用Clustal W軟件進行比對,通過MEGA Version3.1軟件構建基于平均遺傳距離的NJ(neighbor-joining,鄰接法)分子繫統進化樹,用Dnasp4.0分析所有序列的多態位點、覈苷痠多樣性、單倍型數目、單倍型多樣性以及進行Tajima's中性顯著性檢驗.結果 四箇種群34箇東方田鼠箇體的mtDNA D-loop區全序列共髮現19箇單倍型,單倍型比例為55.88%,單倍型多樣性和覈苷痠多樣性分彆為0.934±0.024和0.04334±0.00285.以檯灣田鼠(Microtus kikuchii)線粒體全序列(GenBank登錄號AF348082)為對照,共檢測到覈苷痠變異位點172箇,約佔覈苷痠總教的18.66%.由分子繫統進化樹可髮現所有34隻東方田鼠分為兩大類,小體型黑龍江東方田鼠為一類,其他三箇種群東方田鼠為另外一類,在這一類彆中,又有兩箇分支,其中所有寧夏種群鼠及3隻大體型黑龍江種群鼠為一箇分支,所有洞庭湖種群鼠和其他5隻大體型黑龍江種群鼠為另一箇分支.結論 我國東方田鼠在mt DNA D-loop片段存在種內遺傳多態性,種群內和種群間都存在一定的遺傳變異,併且黑龍江小體型種群東方田鼠錶現齣與其他三種群東方田鼠更大的差異水平.
목적 탐토아국불동지구동방전서선립체DNA D-loop다태성.방법 대사개충군동방전서선립체DNA(mt DNA)D-loop편단진행측서,병대측서결과용Clustal W연건진행비대,통과MEGA Version3.1연건구건기우평균유전거리적NJ(neighbor-joining,린접법)분자계통진화수,용Dnasp4.0분석소유서렬적다태위점、핵감산다양성、단배형수목、단배형다양성이급진행Tajima's중성현저성검험.결과 사개충군34개동방전서개체적mtDNA D-loop구전서렬공발현19개단배형,단배형비례위55.88%,단배형다양성화핵감산다양성분별위0.934±0.024화0.04334±0.00285.이태만전서(Microtus kikuchii)선립체전서렬(GenBank등록호AF348082)위대조,공검측도핵감산변이위점172개,약점핵감산총교적18.66%.유분자계통진화수가발현소유34지동방전서분위량대류,소체형흑룡강동방전서위일류,기타삼개충군동방전서위령외일류,재저일유별중,우유량개분지,기중소유저하충군서급3지대체형흑룡강충군서위일개분지,소유동정호충군서화기타5지대체형흑룡강충군서위령일개분지.결론 아국동방전서재mt DNA D-loop편단존재충내유전다태성,충군내화충군간도존재일정적유전변이,병차흑룡강소체형충군동방전서표현출여기타삼충군동방전서경대적차이수평.