CAJ | 학술논문

对大额牛Myf-5基因进行PCR扩增、T-A克隆和序列分析,并应用DNAMAN4.0、BioEdit 4.8.10、DnaSP4.10、Mega3.1等生物信息学软件同普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼9个物种相应基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对分析,在此基础上采用NJ、ME和UPGMA法对其编码区核苷酸序列构建了分子系统进化树.结果表明:①大额牛Myf-5基因由3个外显子和2个内含子组成,其大小分别为660、76、1 226、852、407 bp;外显子和内含子数与其他9个物种相同,但大小存在较大的差异;外显子与内含子连接区遵循GT-AG基因组成规则.②大额牛与普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼的Myf-5基因编码区核苷酸序列同源性分别为99.0%、90.0%、90.5%、90.5%、87.2%、84.8%、72.9%、64.3%、51.8%,相应的氨基酸序列同源性分别为99.6%、94.9%、94.6%、94.9%、89.9%、88.7%、81.6%、70.4%、56.6%,这说明大额牛与其他9个物种在Myf-5基因的编码区核苷酸和相应氨基酸序列上具有较高的保守性.③用NJ、ME和UPGMA等3种方法聚类构建的分子系统进化树表明,3种方法的聚类结果基本一致,即大额牛与普通牛首先聚为一类,人、黑猩猩、恒河猴也先聚为一类,这两类相聚后再依次同其他物种聚在一起.这与mtDNA、其他功能基因和动物学分类的研究结果一致,表明Myf-5基因适合用于物种间系统进化关系的研究.
대대액우Myf-5기인진행PCR확증、T-A극륭화서렬분석,병응용DNAMAN4.0、BioEdit 4.8.10、DnaSP4.10、Mega3.1등생물신식학연건동보통우、흑성성、항하후、인、구、가서、연체패각、계、반마어9개물충상응기인편마구핵감산서렬화안기산서렬진행료비대분석,재차기출상채용NJ、ME화UPGMA법대기편마구핵감산서렬구건료분자계통진화수.결과표명:①대액우Myf-5기인유3개외현자화2개내함자조성,기대소분별위660、76、1 226、852、407 bp;외현자화내함자수여기타9개물충상동,단대소존재교대적차이;외현자여내함자련접구준순GT-AG기인조성규칙.②대액우여보통우、흑성성、항하후、인、구、가서、연체패각、계、반마어적Myf-5기인편마구핵감산서렬동원성분별위99.0%、90.0%、90.5%、90.5%、87.2%、84.8%、72.9%、64.3%、51.8%,상응적안기산서렬동원성분별위99.6%、94.9%、94.6%、94.9%、89.9%、88.7%、81.6%、70.4%、56.6%,저설명대액우여기타9개물충재Myf-5기인적편마구핵감산화상응안기산서렬상구유교고적보수성.③용NJ、ME화UPGMA등3충방법취류구건적분자계통진화수표명,3충방법적취류결과기본일치,즉대액우여보통우수선취위일류,인、흑성성、항하후야선취위일류,저량류상취후재의차동기타물충취재일기.저여mtDNA、기타공능기인화동물학분류적연구결과일치,표명Myf-5기인괄합용우물충간계통진화관계적연구.