化学学报
化學學報
화학학보
ACTA CHIMICA SINICA
2005年
20期
1875-1883
,共9页
肾上腺素能受体%拮抗剂%同源模型%分子模拟%分子对接
腎上腺素能受體%拮抗劑%同源模型%分子模擬%分子對接
신상선소능수체%길항제%동원모형%분자모의%분자대접
采用同源建模法对α1A-,α1B-和α1D-AR的三维结构进行了模拟,并采用分子力学、分子动力学方法对所得同源模型进行优化,然后分别采用训练集拮抗剂对接的方法得到拮抗状态下的α1A-,α1B-和α1D-AR三维结构模型.得到的模型再采用FRED对接软件对测试集中的18个化合物进行对接并打分,再将所得打分结果与其活性进行线性回归,其回归结果具有良好的拟合效果,由此回归方程预测的活性与化合物实验值较吻合,说明我们建立的拮抗状态下的α1A-,α1B-和α1D-AR的三维同源模型具有一定的合理性,可作为化合物虚拟筛选模型,对新化合物进行对接虚拟筛选.
採用同源建模法對α1A-,α1B-和α1D-AR的三維結構進行瞭模擬,併採用分子力學、分子動力學方法對所得同源模型進行優化,然後分彆採用訓練集拮抗劑對接的方法得到拮抗狀態下的α1A-,α1B-和α1D-AR三維結構模型.得到的模型再採用FRED對接軟件對測試集中的18箇化閤物進行對接併打分,再將所得打分結果與其活性進行線性迴歸,其迴歸結果具有良好的擬閤效果,由此迴歸方程預測的活性與化閤物實驗值較吻閤,說明我們建立的拮抗狀態下的α1A-,α1B-和α1D-AR的三維同源模型具有一定的閤理性,可作為化閤物虛擬篩選模型,對新化閤物進行對接虛擬篩選.
채용동원건모법대α1A-,α1B-화α1D-AR적삼유결구진행료모의,병채용분자역학、분자동역학방법대소득동원모형진행우화,연후분별채용훈련집길항제대접적방법득도길항상태하적α1A-,α1B-화α1D-AR삼유결구모형.득도적모형재채용FRED대접연건대측시집중적18개화합물진행대접병타분,재장소득타분결과여기활성진행선성회귀,기회귀결과구유량호적의합효과,유차회귀방정예측적활성여화합물실험치교문합,설명아문건립적길항상태하적α1A-,α1B-화α1D-AR적삼유동원모형구유일정적합이성,가작위화합물허의사선모형,대신화합물진행대접허의사선.
