利用高通量测序快速检测疑似感染患者体内未知病原体
이용고통량측서쾌속검측의사감염환자체내미지병원체
Rapid detection of potential new pathogens in patient using high -throughput sequencing
  • 万方数据
    生物信息学 생물신식학
    BIOINFORMATICS
    2011年 4期 303-306,313 ,共5页

    李建彬%庄璐%安小平%米志强%范华昊%李存%陈斌%刘玮%鲍一丹%罗征秀%刘恩梅%方祥%童贻刚

    리건빈%장로%안소평%미지강%범화호%리존%진빈%류위%포일단%라정수%류은매%방상%동이강

    高通量测序%未知病原体检测%内源性病毒K113 高通量測序%未知病原體檢測%內源性病毒K113
    고통량측서%미지병원체검측%내원성병독K113
    采用第二代高通量测序技术从复杂的疑似感染患者组织标本中直接快速检测未知病原体.方法:取临床和实验室均不能确诊的病人血液和淋巴组织,进行病毒DNA和RNA的提取,直接用于第二代高通量测序,将测序结果用于生物信息学分析,与本地化的病毒核酸数据库进行比对,寻找潜在的病毒序列.结果:生物信息学分析显示,3901条序列reads与人内源性病毒K113同源；当使用K113特异性引物对经过Dnasel处理的患者和正常个体进行荧光定量RT - PCR时,发现在患者体内K113病毒基因的表达远远高于正常个体,提示该患者可能存在K113病毒的感染.结论:第二代高通量测序可能用于快速检测未知病原体.
    채용제이대고통량측서기술종복잡적의사감염환자조직표본중직접쾌속검측미지병원체.방법:취림상화실험실균불능학진적병인혈액화림파조직,진행병독DNA화RNA적제취,직접용우제이대고통량측서,장측서결과용우생물신식학분석,여본지화적병독핵산수거고진행비대,심조잠재적병독서렬.결과:생물신식학분석현시,3901조서렬reads여인내원성병독K113동원；당사용K113특이성인물대경과Dnasel처리적환자화정상개체진행형광정량RT - PCR시,발현재환자체내K113병독기인적표체원원고우정상개체,제시해환자가능존재K113병독적감염.결론:제이대고통량측서가능용우쾌속검측미지병원체.
    원문보기 원문다운로드 사이트로이동
저자의 최근 논문