生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2010年
7期
161-167
,共7页
猪%小眼畸形相关转录因子%电子重排%比较基因组学
豬%小眼畸形相關轉錄因子%電子重排%比較基因組學
저%소안기형상관전록인자%전자중배%비교기인조학
Mitf(Microphthalmia-associtated transcription factor)是小眼畸形相关转录因子,在黑色素细胞的发育、分化和功能调节上起着重要作用,同时还参与了其它3种细胞包括肥大细胞、破骨细胞和眼色素上皮细胞的发育和分化.针对猪的Mitf基因,从GenBank核酸数据库和proenseml网站下载4条猪的含有Mitf基因片段的基因组序列与牛、人、鼠3种物种的Mitf基因组序列进行比较基因组分析,结果发现,下载的猪Mitf基因组序列或没有排序,或存在一定错误排列.通过生物信息学和比较基因组分析,将猪Mitf基因的基因组序列进行重新组装,得到由6条有序基因组片段组成的较为完整的Mitf基因组序列,并根据人类Mitf基因的转录本信息推测出5种不同猪Mitf基因的转录本.进化分析表明,在人类、小鼠、猪、牛、马和狗中,猪和牛Mitf基因的进化关系最近,提示做猪基因的生物信息学分析可借鉴牛的基因分析结果.
Mitf(Microphthalmia-associtated transcription factor)是小眼畸形相關轉錄因子,在黑色素細胞的髮育、分化和功能調節上起著重要作用,同時還參與瞭其它3種細胞包括肥大細胞、破骨細胞和眼色素上皮細胞的髮育和分化.針對豬的Mitf基因,從GenBank覈痠數據庫和proenseml網站下載4條豬的含有Mitf基因片段的基因組序列與牛、人、鼠3種物種的Mitf基因組序列進行比較基因組分析,結果髮現,下載的豬Mitf基因組序列或沒有排序,或存在一定錯誤排列.通過生物信息學和比較基因組分析,將豬Mitf基因的基因組序列進行重新組裝,得到由6條有序基因組片段組成的較為完整的Mitf基因組序列,併根據人類Mitf基因的轉錄本信息推測齣5種不同豬Mitf基因的轉錄本.進化分析錶明,在人類、小鼠、豬、牛、馬和狗中,豬和牛Mitf基因的進化關繫最近,提示做豬基因的生物信息學分析可藉鑒牛的基因分析結果.
Mitf(Microphthalmia-associtated transcription factor)시소안기형상관전록인자,재흑색소세포적발육、분화화공능조절상기착중요작용,동시환삼여료기타3충세포포괄비대세포、파골세포화안색소상피세포적발육화분화.침대저적Mitf기인,종GenBank핵산수거고화proenseml망참하재4조저적함유Mitf기인편단적기인조서렬여우、인、서3충물충적Mitf기인조서렬진행비교기인조분석,결과발현,하재적저Mitf기인조서렬혹몰유배서,혹존재일정착오배렬.통과생물신식학화비교기인조분석,장저Mitf기인적기인조서렬진행중신조장,득도유6조유서기인조편단조성적교위완정적Mitf기인조서렬,병근거인류Mitf기인적전록본신식추측출5충불동저Mitf기인적전록본.진화분석표명,재인류、소서、저、우、마화구중,저화우Mitf기인적진화관계최근,제시주저기인적생물신식학분석가차감우적기인분석결과.
