生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2008年
5期
531-535
,共5页
张松%夏学峰%沈金城%孙之荣
張鬆%夏學峰%瀋金城%孫之榮
장송%하학봉%침금성%손지영
亚细胞定位%氨基酸组成%序列保守性%蛋白质相互作用%支持向量机
亞細胞定位%氨基痠組成%序列保守性%蛋白質相互作用%支持嚮量機
아세포정위%안기산조성%서렬보수성%단백질상호작용%지지향량궤
蛋白质的亚细胞定位是进行蛋白质功能研究的重要信息.蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能.尝试了将保守序列及蛋白质相互作用数据的编码信息结合传统的氨基酸组成编码,采用支持向量机进行蛋白质亚细胞定位预测,在真核生物中5轮交叉验证精度达到91.8%,得到了显著的提高.
蛋白質的亞細胞定位是進行蛋白質功能研究的重要信息.蛋白質閤成後被轉運到特定的細胞器中,隻有轉運到正確的部位纔能參與細胞的各種生命活動,有效地髮揮功能.嘗試瞭將保守序列及蛋白質相互作用數據的編碼信息結閤傳統的氨基痠組成編碼,採用支持嚮量機進行蛋白質亞細胞定位預測,在真覈生物中5輪交扠驗證精度達到91.8%,得到瞭顯著的提高.
단백질적아세포정위시진행단백질공능연구적중요신식.단백질합성후피전운도특정적세포기중,지유전운도정학적부위재능삼여세포적각충생명활동,유효지발휘공능.상시료장보수서렬급단백질상호작용수거적편마신식결합전통적안기산조성편마,채용지지향량궤진행단백질아세포정위예측,재진핵생물중5륜교차험증정도체도91.8%,득도료현저적제고.