热带医学杂志
熱帶醫學雜誌
열대의학잡지
JOURNAL OF TROPICAL MEDICINE
2008年
7期
642-645,663
,共5页
郎书源%杜武英%黄江%胡旭初%徐劲%余新炳%包怀恩%廖兴江
郎書源%杜武英%黃江%鬍旭初%徐勁%餘新炳%包懷恩%廖興江
랑서원%두무영%황강%호욱초%서경%여신병%포부은%료흥강
亚洲牛带绦虫%WD40%结构与功能%生物信息学
亞洲牛帶縚蟲%WD40%結構與功能%生物信息學
아주우대조충%WD40%결구여공능%생물신식학
目的 分析和预测亚洲牛带绦虫WD40基因及其编码蛋白的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究.方法 利用美国国家生物技术信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http://ca.expasy.org/)和IEDB Analysis Recource提供的各种生物信息学在线分析程序.结合其它生物信息学分析软件包如Pcgene和Vector NTI suite,从亚洲牛带绦虫全长cDNA质粒文库中识别WD40基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等.结果 该基因全长1 208 bp,编码区为81～1 056 bp,编码402个氨基酸,为全长基因;无跨膜区,具有多个磷酸化位点,蛋白的理化性质稳定,理论分子量为35 942.4;没有质体、线粒体定位序列;预测该蛋白表面有三个亲水性强的线性表位和三个B细胞抗原表位.结论 应用生物信息方法从亚洲牛带绦虫成虫cDNA文库中识别出了亚洲牛带绦虫WD40基因,并对其所编码的蛋白质的结构与功能进行了预测.
目的 分析和預測亞洲牛帶縚蟲WD40基因及其編碼蛋白的結構和特性,用于指導其生物學功能的實驗研究.方法 利用美國國傢生物技術信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、瑞士生物信息學研究所的蛋白分析專傢繫統(ExPASY,http://ca.expasy.org/)和IEDB Analysis Recource提供的各種生物信息學在線分析程序.結閤其它生物信息學分析軟件包如Pcgene和Vector NTI suite,從亞洲牛帶縚蟲全長cDNA質粒文庫中識彆WD40基因及其編碼區,分析、預測該基因編碼的蛋白質的理化特性、翻譯後的脩飾位點、功能域、亞細胞定位、拓撲結構、二級結構、三維空間構象等.結果 該基因全長1 208 bp,編碼區為81～1 056 bp,編碼402箇氨基痠,為全長基因;無跨膜區,具有多箇燐痠化位點,蛋白的理化性質穩定,理論分子量為35 942.4;沒有質體、線粒體定位序列;預測該蛋白錶麵有三箇親水性彊的線性錶位和三箇B細胞抗原錶位.結論 應用生物信息方法從亞洲牛帶縚蟲成蟲cDNA文庫中識彆齣瞭亞洲牛帶縚蟲WD40基因,併對其所編碼的蛋白質的結構與功能進行瞭預測.
목적 분석화예측아주우대조충WD40기인급기편마단백적결구화특성,용우지도기생물학공능적실험연구.방법 이용미국국가생물기술신식중심(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、서사생물신식학연구소적단백분석전가계통(ExPASY,http://ca.expasy.org/)화IEDB Analysis Recource제공적각충생물신식학재선분석정서.결합기타생물신식학분석연건포여Pcgene화Vector NTI suite,종아주우대조충전장cDNA질립문고중식별WD40기인급기편마구,분석、예측해기인편마적단백질적이화특성、번역후적수식위점、공능역、아세포정위、탁복결구、이급결구、삼유공간구상등.결과 해기인전장1 208 bp,편마구위81～1 056 bp,편마402개안기산,위전장기인;무과막구,구유다개린산화위점,단백적이화성질은정,이론분자량위35 942.4;몰유질체、선립체정위서렬;예측해단백표면유삼개친수성강적선성표위화삼개B세포항원표위.결론 응용생물신식방법종아주우대조충성충cDNA문고중식별출료아주우대조충WD40기인,병대기소편마적단백질적결구여공능진행료예측.
