河南农业科学
河南農業科學
하남농업과학
JOURNAL OF HENAN AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
10期
144-148
,共5页
刘伟兰%李祥龙%周荣艳%李兰会%杨清芳
劉偉蘭%李祥龍%週榮豔%李蘭會%楊清芳
류위란%리상룡%주영염%리란회%양청방
TYRP2基因%遗传多样性%系统发育%多肽信息%动物毛色
TYRP2基因%遺傳多樣性%繫統髮育%多肽信息%動物毛色
TYRP2기인%유전다양성%계통발육%다태신식%동물모색
应用生物信息学和比较基因组学方法,比较分析了人、毛猩猩、绵羊、牛、猪、马、犬、斑马鱼、大熊猫、小家鼠、褐家鼠、鸭嘴兽、非洲爪蟾、原鸡、绿头鸭、斑胸草雀、黑猩猩、恒河猕猴、狨、灰短尾负鼠和兔21个物种T YR P2基因完整编码区(CDS),并对其遗传多样性、分子系统发育、编码蛋白的氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、二级结构等进行了预测.结果表明,从21个物种的42条基因序列检测到741个多态位点,共生成26种单倍型.物种间TYRP2基因序列编码区存在较丰富的遗传多样性,物种内该基因序列编码区则存在较强的保守性.TYRP2基因密码子有较强的偏爱性.根据核苷酸歧异度和遗传分化系数对物种的亲缘关系进行分析,结果表明,人与黑猩猩亲缘关系最近,小家鼠和褐家鼠亲缘关系最近.TYRP2基因多肽存在信号肽,有跨膜结构域,表现为疏水性,二级结构的主要组成元件为无规卷曲和a螺旋.
應用生物信息學和比較基因組學方法,比較分析瞭人、毛猩猩、綿羊、牛、豬、馬、犬、斑馬魚、大熊貓、小傢鼠、褐傢鼠、鴨嘴獸、非洲爪蟾、原鷄、綠頭鴨、斑胸草雀、黑猩猩、恆河獼猴、狨、灰短尾負鼠和兔21箇物種T YR P2基因完整編碼區(CDS),併對其遺傳多樣性、分子繫統髮育、編碼蛋白的氨基痠序列、信號肽、跨膜結構域、疏水性/親水性、二級結構等進行瞭預測.結果錶明,從21箇物種的42條基因序列檢測到741箇多態位點,共生成26種單倍型.物種間TYRP2基因序列編碼區存在較豐富的遺傳多樣性,物種內該基因序列編碼區則存在較彊的保守性.TYRP2基因密碼子有較彊的偏愛性.根據覈苷痠歧異度和遺傳分化繫數對物種的親緣關繫進行分析,結果錶明,人與黑猩猩親緣關繫最近,小傢鼠和褐傢鼠親緣關繫最近.TYRP2基因多肽存在信號肽,有跨膜結構域,錶現為疏水性,二級結構的主要組成元件為無規捲麯和a螺鏇.
응용생물신식학화비교기인조학방법,비교분석료인、모성성、면양、우、저、마、견、반마어、대웅묘、소가서、갈가서、압취수、비주조섬、원계、록두압、반흉초작、흑성성、항하미후、융、회단미부서화토21개물충T YR P2기인완정편마구(CDS),병대기유전다양성、분자계통발육、편마단백적안기산서렬、신호태、과막결구역、소수성/친수성、이급결구등진행료예측.결과표명,종21개물충적42조기인서렬검측도741개다태위점,공생성26충단배형.물충간TYRP2기인서렬편마구존재교봉부적유전다양성,물충내해기인서렬편마구칙존재교강적보수성.TYRP2기인밀마자유교강적편애성.근거핵감산기이도화유전분화계수대물충적친연관계진행분석,결과표명,인여흑성성친연관계최근,소가서화갈가서친연관계최근.TYRP2기인다태존재신호태,유과막결구역,표현위소수성,이급결구적주요조성원건위무규권곡화a라선.