农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2012年
4期
426-435
,共10页
汪金兔%李炯棠%万玉美%冀培丰%崔润滋%张研%蒋丽%徐鹏%孙效文
汪金兔%李炯棠%萬玉美%冀培豐%崔潤滋%張研%蔣麗%徐鵬%孫效文
왕금토%리형당%만옥미%기배봉%최윤자%장연%장려%서붕%손효문
鲤%免疫反应%CC趋化因子%克隆%脂多糖%序列保守性
鯉%免疫反應%CC趨化因子%剋隆%脂多糖%序列保守性
리%면역반응%CC추화인자%극륭%지다당%서렬보수성
趋化因子家族是一类能诱导白细胞激活和迁移的趋化性细胞因子家族,是鱼类先天免疫的重要组成部分.CC类家族是趋化因子家族中最大的家族之一.为研究鲤CC类家族成员的组织表达和进化模式,以及进一步研究鲤CC类趋化因子的免疫调控机制,本研究选择该家族其中的一个基因,CCL-C5a样基因,根据EST序列结合RACE方法从鲤(Cyprinus carpio)脾脏中克降了该基因的全长cDNA序列(GenBank登录号:JQ026408).该序列全长830 bp,5端非翻译区174 bp,3端非翻译区296 bp,开放阅读框360 bp,编码一个由119个氨基酸组成的蛋白.结构域分析发现,该蛋白质含有分泌信弓肽和保守的趋化因子结构域;Gene Ontology注释该基因参与免疫细胞迁移的生物学过程.CCL-C5a基因在鲤10个组织中表达,其中在脾和肝的表达量最高.脂多糖刺激鲤外周血白细胞和头肾白细胞后,该基因表达量出现显著上升.氨基酸序列保守性分析表明,鲤CCL-C5a样趋化因子与斑马鱼(Danio rerio)的同源性最高,为61%,与蓝鲶(Ictalurus futrcatus)、沟鲶(Ictalurusp unctatus)和大西洋鲑(Salmo salar)的同源性分别为47%、47%和42%;与人(Homo sapiens)CCL19蛋白的同源性为37%.适应性进化分析发现,鲤与斑马鱼CCL-C5a的Ka/Ks小于1,说明CCL-C5a基因在鱼类的进化过程受到负选择压作用.本研究结果表明,鲤CCL-C5a主要在免疫器官上高表达,并受到脂多糖诱导表达上升;同时该基因在鱼类中受到负选择作用.这些结果提示CCL-C5a可能是一个与免疫相关的基因.
趨化因子傢族是一類能誘導白細胞激活和遷移的趨化性細胞因子傢族,是魚類先天免疫的重要組成部分.CC類傢族是趨化因子傢族中最大的傢族之一.為研究鯉CC類傢族成員的組織錶達和進化模式,以及進一步研究鯉CC類趨化因子的免疫調控機製,本研究選擇該傢族其中的一箇基因,CCL-C5a樣基因,根據EST序列結閤RACE方法從鯉(Cyprinus carpio)脾髒中剋降瞭該基因的全長cDNA序列(GenBank登錄號:JQ026408).該序列全長830 bp,5耑非翻譯區174 bp,3耑非翻譯區296 bp,開放閱讀框360 bp,編碼一箇由119箇氨基痠組成的蛋白.結構域分析髮現,該蛋白質含有分泌信弓肽和保守的趨化因子結構域;Gene Ontology註釋該基因參與免疫細胞遷移的生物學過程.CCL-C5a基因在鯉10箇組織中錶達,其中在脾和肝的錶達量最高.脂多糖刺激鯉外週血白細胞和頭腎白細胞後,該基因錶達量齣現顯著上升.氨基痠序列保守性分析錶明,鯉CCL-C5a樣趨化因子與斑馬魚(Danio rerio)的同源性最高,為61%,與藍鯰(Ictalurus futrcatus)、溝鯰(Ictalurusp unctatus)和大西洋鮭(Salmo salar)的同源性分彆為47%、47%和42%;與人(Homo sapiens)CCL19蛋白的同源性為37%.適應性進化分析髮現,鯉與斑馬魚CCL-C5a的Ka/Ks小于1,說明CCL-C5a基因在魚類的進化過程受到負選擇壓作用.本研究結果錶明,鯉CCL-C5a主要在免疫器官上高錶達,併受到脂多糖誘導錶達上升;同時該基因在魚類中受到負選擇作用.這些結果提示CCL-C5a可能是一箇與免疫相關的基因.
추화인자가족시일류능유도백세포격활화천이적추화성세포인자가족,시어류선천면역적중요조성부분.CC류가족시추화인자가족중최대적가족지일.위연구리CC류가족성원적조직표체화진화모식,이급진일보연구리CC류추화인자적면역조공궤제,본연구선택해가족기중적일개기인,CCL-C5a양기인,근거EST서렬결합RACE방법종리(Cyprinus carpio)비장중극강료해기인적전장cDNA서렬(GenBank등록호:JQ026408).해서렬전장830 bp,5단비번역구174 bp,3단비번역구296 bp,개방열독광360 bp,편마일개유119개안기산조성적단백.결구역분석발현,해단백질함유분비신궁태화보수적추화인자결구역;Gene Ontology주석해기인삼여면역세포천이적생물학과정.CCL-C5a기인재리10개조직중표체,기중재비화간적표체량최고.지다당자격리외주혈백세포화두신백세포후,해기인표체량출현현저상승.안기산서렬보수성분석표명,리CCL-C5a양추화인자여반마어(Danio rerio)적동원성최고,위61%,여람염(Ictalurus futrcatus)、구염(Ictalurusp unctatus)화대서양해(Salmo salar)적동원성분별위47%、47%화42%;여인(Homo sapiens)CCL19단백적동원성위37%.괄응성진화분석발현,리여반마어CCL-C5a적Ka/Ks소우1,설명CCL-C5a기인재어류적진화과정수도부선택압작용.본연구결과표명,리CCL-C5a주요재면역기관상고표체,병수도지다당유도표체상승;동시해기인재어류중수도부선택작용.저사결과제시CCL-C5a가능시일개여면역상관적기인.