生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2012年
2期
59-64
,共6页
孙静文%赵世诚%范洪黎%周卫
孫靜文%趙世誠%範洪黎%週衛
손정문%조세성%범홍려%주위
苋菜%铁转运蛋白%克隆%基因表达%IRT1基因
莧菜%鐵轉運蛋白%剋隆%基因錶達%IRT1基因
현채%철전운단백%극륭%기인표체%IRT1기인
通过对镉超积累苋菜品种天星米铁转运蛋白基因( IRT1)的克隆、序列及表达分析,旨在为植物修复镉污染土壤奠定基础.依据同源克隆原理,通过RACE技术克隆苋菜IRT1基因及生物信息学方法分析基因序列结构和功能,Northern杂交研究基因表达.苋菜IRT1基因cDNA全长1135 bp,包含完整的阅读框,编码322个氨基酸.苋菜IRT1蛋白与已知铁转运蛋白相似性在53.70％-63.04％,具有铁转运蛋白典型的功能结构特征,即N端含有1个信号肽、氨基酸序列上具有完整的ZIP家族功能结构域( Pfam:Zip)和7个跨膜结构域(TMs).苋菜IRT1蛋白还具有1个COG0428超级家族(转运二价金属离子功能)、2个蛋白激酶C磷酸化位点和2个酪蛋白Ⅱ磷酸化位点.低铁胁迫时苋菜根中IRT1基因表达量增加,加镉处理没有改变IRT1基因表达量.因此,推断苋菜IRT1基因是ZIP家族的一员,具有转运二价金属离子功能,将基因在GenBank中注册,序列号为:GU363501,命名为AmIRT1.
通過對鎘超積纍莧菜品種天星米鐵轉運蛋白基因( IRT1)的剋隆、序列及錶達分析,旨在為植物脩複鎘汙染土壤奠定基礎.依據同源剋隆原理,通過RACE技術剋隆莧菜IRT1基因及生物信息學方法分析基因序列結構和功能,Northern雜交研究基因錶達.莧菜IRT1基因cDNA全長1135 bp,包含完整的閱讀框,編碼322箇氨基痠.莧菜IRT1蛋白與已知鐵轉運蛋白相似性在53.70％-63.04％,具有鐵轉運蛋白典型的功能結構特徵,即N耑含有1箇信號肽、氨基痠序列上具有完整的ZIP傢族功能結構域( Pfam:Zip)和7箇跨膜結構域(TMs).莧菜IRT1蛋白還具有1箇COG0428超級傢族(轉運二價金屬離子功能)、2箇蛋白激酶C燐痠化位點和2箇酪蛋白Ⅱ燐痠化位點.低鐵脅迫時莧菜根中IRT1基因錶達量增加,加鎘處理沒有改變IRT1基因錶達量.因此,推斷莧菜IRT1基因是ZIP傢族的一員,具有轉運二價金屬離子功能,將基因在GenBank中註冊,序列號為:GU363501,命名為AmIRT1.
통과대력초적루현채품충천성미철전운단백기인( IRT1)적극륭、서렬급표체분석,지재위식물수복력오염토양전정기출.의거동원극륭원리,통과RACE기술극륭현채IRT1기인급생물신식학방법분석기인서렬결구화공능,Northern잡교연구기인표체.현채IRT1기인cDNA전장1135 bp,포함완정적열독광,편마322개안기산.현채IRT1단백여이지철전운단백상사성재53.70％-63.04％,구유철전운단백전형적공능결구특정,즉N단함유1개신호태、안기산서렬상구유완정적ZIP가족공능결구역( Pfam:Zip)화7개과막결구역(TMs).현채IRT1단백환구유1개COG0428초급가족(전운이개금속리자공능)、2개단백격매C린산화위점화2개락단백Ⅱ린산화위점.저철협박시현채근중IRT1기인표체량증가,가력처리몰유개변IRT1기인표체량.인차,추단현채IRT1기인시ZIP가족적일원,구유전운이개금속리자공능,장기인재GenBank중주책,서렬호위:GU363501,명명위AmIRT1.
