CAJ | 학술논문

目的应用液体芯片-飞行时间质谱系统分析肺癌与对照组血清差异表达蛋白,筛选肺癌标志蛋白.方法将105例肺癌患者和90例对照者[44名正常人,46例良性肺疾病(BLDs)]的血清随机分成训练组(肺癌和对照各60例)和验证组[肺癌45例(早期13例,晚期32例),对照30例(正常及BLDs各15例)].应用ClinProt及相关分析工具软件ClinProTools结合遗传算法(GA)等生物统计学和生物信息学方法分析上述195份血清.进行归一化平滑处理总离子流图(TIC),消除化学及电物理噪声;分析组间差异蛋白并计算差异大小,后按差异大小由大到小排列;应用GA对各差异蛋白的敏感性及特异性进行初步评价,建立判别模型并验证.结果比较肺癌及对照血清蛋白表达谱时共发现98个差异蛋白峰.质荷比(m/z)分别为1865.81u和4054u的蛋白在两组间差异最大,且这两种蛋白在肺癌组各样品谱图中的丰度大于正常对照组;以蛋白1865.81u为X轴,4054u为Y轴建立坐标系(坐标值代表相应蛋白丰度),观察样品分布,可见两组样品混杂差区域较小,说明这两种蛋白的区分肺癌和对照(正常人和BLDs)的能力良好.应用GA,以训练组数据建立判别模型时,系统筛选出一个由m/z分别为3192.08、2862.55、4643.49、5336.64、3954.88、9288.98u及4209.64u的7个特征峰组成的诊断模型.以验证组数据进行交叉验证时,该模型对肺癌及对照的识别率分别为82.22%(37/45)和80.00%(24/30),对早期肺癌的识别率为76.92%(10/13).鉴定所得到的m/z分别为1778、1865、4209u蛋白峰,得出前两个蛋白峰均为C3f,而4209u则为真核细胞肽链释放因子.结论肺癌患者与正常人及BLDs患者血清蛋白质表达谱之间存在差异;使用ClinProTools结合GA等生物信息学方法有望筛选出肺癌诊断标志蛋白.
목적 응용액체심편-비행시간질보계통분석폐암여대조조혈청차이표체단백,사선폐암표지단백.방법 장105례폐암환자화90례대조자[44명정상인,46례량성폐질병(BLDs)]적혈청수궤분성훈련조(폐암화대조각60례)화험증조[폐암45례(조기13례,만기32례),대조30례(정상급BLDs각15례)].응용ClinProt급상관분석공구연건ClinProTools결합유전산법(GA)등생물통계학화생물신식학방법분석상술195빈혈청.진행귀일화평활처리총리자류도(TIC),소제화학급전물리조성;분석조간차이단백병계산차이대소,후안차이대소유대도소배렬;응용GA대각차이단백적민감성급특이성진행초보평개,건립판별모형병험증.결과 비교폐암급대조혈청단백표체보시공발현98개차이단백봉.질하비(m/z)분별위1865.81u화4054u적단백재량조간차이최대,차저량충단백재폐암조각양품보도중적봉도대우정상대조조;이단백1865.81u위X축,4054u위Y축건립좌표계(좌표치대표상응단백봉도),관찰양품분포,가견량조양품혼잡차구역교소,설명저량충단백적구분폐암화대조(정상인화BLDs)적능력량호.응용GA,이훈련조수거건립판별모형시,계통사선출일개유m/z분별위3192.08、2862.55、4643.49、5336.64、3954.88、9288.98u급4209.64u적7개특정봉조성적진단모형.이험증조수거진행교차험증시,해모형대폐암급대조적식별솔분별위82.22%(37/45)화80.00%(24/30),대조기폐암적식별솔위76.92%(10/13).감정소득도적m/z분별위1778、1865、4209u단백봉,득출전량개단백봉균위C3f,이4209u칙위진핵세포태련석방인자.결론 폐암환자여정상인급BLDs환자혈청단백질표체보지간존재차이;사용ClinProTools결합GA등생물신식학방법유망사선출폐암진단표지단백.