江苏农业学报
江囌農業學報
강소농업학보
JIANGSU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
3期
617-622
,共6页
刘同坤%李英%王枫%孙菲菲%张蜀宁%侯喜林
劉同坤%李英%王楓%孫菲菲%張蜀寧%侯喜林
류동곤%리영%왕풍%손비비%장촉저%후희림
不结球白菜%BcHSP81-4%原核表达%生物信息学
不結毬白菜%BcHSP81-4%原覈錶達%生物信息學
불결구백채%BcHSP81-4%원핵표체%생물신식학
从不结球白菜Pol_CMS胞质不育系SSH差减文库中得到1条热激蛋白基因的EST序列,通过对该基因的NCBI网上BLAST比对发现,与热激蛋白的同源性最高,与拟南芥HSP81-4(AT5G56000)同源性高达96%,命名为BcHSP81-4。将BcHSP81-4基因片段连接到原核表达载体PGEX-4T-3,转化大肠杆菌BL21(DE3)后诱导重组蛋白的表达。经IPTG诱导后进行SDS-PAGE电泳,产生了预期大小的重组蛋白,进一步证明了该基因属于热激蛋白90家族。并采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜热激蛋白BcHSP81-4的理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位及蛋白质结构进行预测和分析。理化性质分析结果显示,该蛋白质含699个氨基酸,分子量为80 050,理论等电点pI值为4.95。TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本对应。用TargetP server和WOLFPSORT server程序预测该蛋白质为细胞质蛋白质,二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。
從不結毬白菜Pol_CMS胞質不育繫SSH差減文庫中得到1條熱激蛋白基因的EST序列,通過對該基因的NCBI網上BLAST比對髮現,與熱激蛋白的同源性最高,與擬南芥HSP81-4(AT5G56000)同源性高達96%,命名為BcHSP81-4。將BcHSP81-4基因片段連接到原覈錶達載體PGEX-4T-3,轉化大腸桿菌BL21(DE3)後誘導重組蛋白的錶達。經IPTG誘導後進行SDS-PAGE電泳,產生瞭預期大小的重組蛋白,進一步證明瞭該基因屬于熱激蛋白90傢族。併採用生物信息學方法,利用多種在線軟件對不結毬白菜熱激蛋白BcHSP81-4的理化性質、親水性、跨膜區、亞細胞定位及蛋白質結構進行預測和分析。理化性質分析結果顯示,該蛋白質含699箇氨基痠,分子量為80 050,理論等電點pI值為4.95。TMpred跨膜分析結果顯示,它含有1箇顯著的跨膜螺鏇區,這箇區域與ProtScale預測的疏水區基本對應。用TargetP server和WOLFPSORT server程序預測該蛋白質為細胞質蛋白質,二級結構以α-螺鏇和隨機捲麯為主。
종불결구백채Pol_CMS포질불육계SSH차감문고중득도1조열격단백기인적EST서렬,통과대해기인적NCBI망상BLAST비대발현,여열격단백적동원성최고,여의남개HSP81-4(AT5G56000)동원성고체96%,명명위BcHSP81-4。장BcHSP81-4기인편단련접도원핵표체재체PGEX-4T-3,전화대장간균BL21(DE3)후유도중조단백적표체。경IPTG유도후진행SDS-PAGE전영,산생료예기대소적중조단백,진일보증명료해기인속우열격단백90가족。병채용생물신식학방법,이용다충재선연건대불결구백채열격단백BcHSP81-4적이화성질、친수성、과막구、아세포정위급단백질결구진행예측화분석。이화성질분석결과현시,해단백질함699개안기산,분자량위80 050,이론등전점pI치위4.95。TMpred과막분석결과현시,타함유1개현저적과막라선구,저개구역여ProtScale예측적소수구기본대응。용TargetP server화WOLFPSORT server정서예측해단백질위세포질단백질,이급결구이α-라선화수궤권곡위주。