癌症
癌癥
암증
CHINESE JOURNAL OF CANCER
2003年
3期
230-234
,共5页
杨兴龙%张亚历%药立波%刘新平%季少平%邢飞跃
楊興龍%張亞歷%藥立波%劉新平%季少平%邢飛躍
양흥룡%장아력%약립파%류신평%계소평%형비약
基因%Ndr2%克隆%生物信息学
基因%Ndr2%剋隆%生物信息學
기인%Ndr2%극륭%생물신식학
背景与目的:人源 Ndr2(N-myc down-stream regulator 2)基因是本室于 1999年从正常人全脑 cDNA文库中克隆到的一个新基因 [GenBank, AF159092].初步实验表明, Ndr2有可能是一个抑癌基因.为进一步研究该基因的功能,我们拟克隆小鼠的 Ndr2的基因组序列.方法:以小鼠的基因组文库为模板,采用 RT-PCR方法扩增 Ndr2基因的基因组片段,用 310 Genetic Analyzer自动测序仪测序, GenBank BLAST相似性分析其与人源 Ndr2基因同源性, Pc Gene和 ORF Finder作读框分析, ProDom软件作结构域分析.结果:经琼脂糖 DNA电泳鉴定,获得一约 3 310 bp大小的特异条带,并克隆入 pMD18-T载体. BLAST相似性分析结果表明该序列与人源 Ndr2基因高度同源 (同源性为 91.4% ),与鼠基因组数据库无同源性.已公布的鼠源 Ndr2 mRNA序列比较发现该基因有 8个外显子, 7个内含子.读框分析表明,该序列编码含 200个氨基酸的蛋白质. ProDom软件分析发现其含有酰基携带蛋白( ACP)样结构域.结论:本研究克隆了一个鼠的 Ndr2基因并已测序.该基因为一新基因,该序列已被 GenBank收录 (登录号: AY151387).
揹景與目的:人源 Ndr2(N-myc down-stream regulator 2)基因是本室于 1999年從正常人全腦 cDNA文庫中剋隆到的一箇新基因 [GenBank, AF159092].初步實驗錶明, Ndr2有可能是一箇抑癌基因.為進一步研究該基因的功能,我們擬剋隆小鼠的 Ndr2的基因組序列.方法:以小鼠的基因組文庫為模闆,採用 RT-PCR方法擴增 Ndr2基因的基因組片段,用 310 Genetic Analyzer自動測序儀測序, GenBank BLAST相似性分析其與人源 Ndr2基因同源性, Pc Gene和 ORF Finder作讀框分析, ProDom軟件作結構域分析.結果:經瓊脂糖 DNA電泳鑒定,穫得一約 3 310 bp大小的特異條帶,併剋隆入 pMD18-T載體. BLAST相似性分析結果錶明該序列與人源 Ndr2基因高度同源 (同源性為 91.4% ),與鼠基因組數據庫無同源性.已公佈的鼠源 Ndr2 mRNA序列比較髮現該基因有 8箇外顯子, 7箇內含子.讀框分析錶明,該序列編碼含 200箇氨基痠的蛋白質. ProDom軟件分析髮現其含有酰基攜帶蛋白( ACP)樣結構域.結論:本研究剋隆瞭一箇鼠的 Ndr2基因併已測序.該基因為一新基因,該序列已被 GenBank收錄 (登錄號: AY151387).
배경여목적:인원 Ndr2(N-myc down-stream regulator 2)기인시본실우 1999년종정상인전뇌 cDNA문고중극륭도적일개신기인 [GenBank, AF159092].초보실험표명, Ndr2유가능시일개억암기인.위진일보연구해기인적공능,아문의극륭소서적 Ndr2적기인조서렬.방법:이소서적기인조문고위모판,채용 RT-PCR방법확증 Ndr2기인적기인조편단,용 310 Genetic Analyzer자동측서의측서, GenBank BLAST상사성분석기여인원 Ndr2기인동원성, Pc Gene화 ORF Finder작독광분석, ProDom연건작결구역분석.결과:경경지당 DNA전영감정,획득일약 3 310 bp대소적특이조대,병극륭입 pMD18-T재체. BLAST상사성분석결과표명해서렬여인원 Ndr2기인고도동원 (동원성위 91.4% ),여서기인조수거고무동원성.이공포적서원 Ndr2 mRNA서렬비교발현해기인유 8개외현자, 7개내함자.독광분석표명,해서렬편마함 200개안기산적단백질. ProDom연건분석발현기함유선기휴대단백( ACP)양결구역.결론:본연구극륭료일개서적 Ndr2기인병이측서.해기인위일신기인,해서렬이피 GenBank수록 (등록호: AY151387).