微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2004年
4期
427-430
,共4页
方再光%黄惠琴%蔡海宝%吕家森%鲍时翔
方再光%黃惠琴%蔡海寶%呂傢森%鮑時翔
방재광%황혜금%채해보%려가삼%포시상
海绵Pachychalina sp.,16S rDNA,细菌多样性
海綿Pachychalina sp.,16S rDNA,細菌多樣性
해면Pachychalina sp.,16S rDNA,세균다양성
通过非分离培养分析方法,直接从海绵体内提取细菌总DNA.以样品总DNA为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA.用16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(ARDRA)和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalina sp.体内的细菌多样性进行了研究.在细菌16S rDNA的ARDRA图谱中,大多数克隆的酶切带谱间存在差异;随机挑选22个克隆进行测序得到它们的16S rDNA部分序列,大部分序列属于γ-proteobacterium和α-proteobacterium,但有少数克隆序列与RDP数据库中收录的16S rDNA序列间的相似性极小,不参与系统发育树的构建.研究结果表明海绵Pachychalina sp.体内细菌组成具有丰富的多样性.
通過非分離培養分析方法,直接從海綿體內提取細菌總DNA.以樣品總DNA為模闆進行PCR擴增穫得細菌16S rDNA.用16S rDNA限製性酶切片段長度多態性(ARDRA)和測序方法對南海湛江海域海綿Pachychalina sp.體內的細菌多樣性進行瞭研究.在細菌16S rDNA的ARDRA圖譜中,大多數剋隆的酶切帶譜間存在差異;隨機挑選22箇剋隆進行測序得到它們的16S rDNA部分序列,大部分序列屬于γ-proteobacterium和α-proteobacterium,但有少數剋隆序列與RDP數據庫中收錄的16S rDNA序列間的相似性極小,不參與繫統髮育樹的構建.研究結果錶明海綿Pachychalina sp.體內細菌組成具有豐富的多樣性.
통과비분리배양분석방법,직접종해면체내제취세균총DNA.이양품총DNA위모판진행PCR확증획득세균16S rDNA.용16S rDNA한제성매절편단장도다태성(ARDRA)화측서방법대남해담강해역해면Pachychalina sp.체내적세균다양성진행료연구.재세균16S rDNA적ARDRA도보중,대다수극륭적매절대보간존재차이;수궤도선22개극륭진행측서득도타문적16S rDNA부분서렬,대부분서렬속우γ-proteobacterium화α-proteobacterium,단유소수극륭서렬여RDP수거고중수록적16S rDNA서렬간적상사성겁소,불삼여계통발육수적구건.연구결과표명해면Pachychalina sp.체내세균조성구유봉부적다양성.
