CAJ | 학술논문

从表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)数据库ZooDDD中获得小鼠正常睾丸表达的EST,通过dbEST数据库检索出与其高度同源的EST序列,构建EST叠加群(contigs),Biolign软件拼接,GeneScan软件预测contigs对应的基因组序列中的外显子、内含子;针对开放阅读框设计引物序列,采用RT-PCR从小鼠睾丸组织中克隆新基因的cDNA,分析该基因在小鼠各脏器中的mRNA表达,并对测序结果进行生物信息学分析.结果表明:在小鼠X染色体的1668～2 011 kb间克隆出一新基因TSEG-1,全长为510 bp,开放阅读框为336 bp,编码111氨基酸,分子量12.84258 kDa,等电点11.4000.RT-PCR证实该基因开放阅读框正确,在小鼠睾丸组织中特异性表达,且与小鼠其他cDNA无同源性,获得GenBank登录号EU079024.功能区分析发现TSEG-1蛋白可能为一种跨膜蛋白,跨膜区位于第41～61氨基酸残基.TSEG-1基因与人类睾丸特异性组蛋白2α变异体基因有较高同源性,在TSEG-1基因5'-端非编码侧翼预测发现存在1个启动子区域,范围为680 bp.TSEG-1蛋白可能有4个抗原性位点,2个特异性蛋白激酶的磷酸化位点,其亚细胞定位可能位于线粒体.小鼠睾丸特异性基因TSEG-1的克隆为进一步研究其生物学功能和表达调控奠定了基础.
종표체서렬표첨(expressed sequence tags,ESTs)수거고ZooDDD중획득소서정상고환표체적EST,통과dbEST수거고검색출여기고도동원적EST서렬,구건EST첩가군(contigs),Biolign연건병접,GeneScan연건예측contigs대응적기인조서렬중적외현자、내함자;침대개방열독광설계인물서렬,채용RT-PCR종소서고환조직중극륭신기인적cDNA,분석해기인재소서각장기중적mRNA표체,병대측서결과진행생물신식학분석.결과표명:재소서X염색체적1668～2 011 kb간극륭출일신기인TSEG-1,전장위510 bp,개방열독광위336 bp,편마111안기산,분자량12.84258 kDa,등전점11.4000.RT-PCR증실해기인개방열독광정학,재소서고환조직중특이성표체,차여소서기타cDNA무동원성,획득GenBank등록호EU079024.공능구분석발현TSEG-1단백가능위일충과막단백,과막구위우제41～61안기산잔기.TSEG-1기인여인류고환특이성조단백2α변이체기인유교고동원성,재TSEG-1기인5'-단비편마측익예측발현존재1개계동자구역,범위위680 bp.TSEG-1단백가능유4개항원성위점,2개특이성단백격매적린산화위점,기아세포정위가능위우선립체.소서고환특이성기인TSEG-1적극륭위진일보연구기생물학공능화표체조공전정료기출.