上海师范大学学报（自然科学版）
上海師範大學學報（自然科學版）
상해사범대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI TEACHERS UNIVERSITY(NATURAL SCIENCES)
2010年
3期
299-308
,共10页
贾侃%赵犇鹏%张艳丽%邵东华%冯新港%林矫矫%李利珍
賈侃%趙犇鵬%張豔麗%邵東華%馮新港%林矯矯%李利珍
가간%조분붕%장염려%소동화%풍신항%림교교%리리진
日本血吸虫%转录本组%蛋白质组%候选疫苗分子%预测
日本血吸蟲%轉錄本組%蛋白質組%候選疫苗分子%預測
일본혈흡충%전록본조%단백질조%후선역묘분자%예측
预测了可能模拟致弱疫苗免疫保护性效果的日本血吸虫抗原分子,为实验鉴定抗日本血吸虫候选疫苗分子提供基础.实验基于已发表的辐照尾蚴转化的童虫的特征性转录本组(曼氏血吸虫)和蛋白质组(日本血吸虫)序列,用BLASTP算法等搜寻来源于正常日本血吸虫童虫和成虫的转录本组和蛋白质组中的序列;应用在线软件、相关数据库及文献对这些序列进行序列注释分析.结果获得了与辐照尾蚴转化的童虫特征性表达的分子同源或一致的日本血吸虫序列131条,它们较高比例地出现在正常童虫高表达的分子集类中;进一步文献分析预测得到了52个日本血吸虫候选疫苗分子,它们的序列特征与存在于血吸虫体被的一些分子和已知的抗血吸虫疫苗分子的相类似.用数据挖掘技术获得了一批日本血吸虫候选疫苗分子,为进一步实验研究奠定了基础.
預測瞭可能模擬緻弱疫苗免疫保護性效果的日本血吸蟲抗原分子,為實驗鑒定抗日本血吸蟲候選疫苗分子提供基礎.實驗基于已髮錶的輻照尾蚴轉化的童蟲的特徵性轉錄本組(曼氏血吸蟲)和蛋白質組(日本血吸蟲)序列,用BLASTP算法等搜尋來源于正常日本血吸蟲童蟲和成蟲的轉錄本組和蛋白質組中的序列;應用在線軟件、相關數據庫及文獻對這些序列進行序列註釋分析.結果穫得瞭與輻照尾蚴轉化的童蟲特徵性錶達的分子同源或一緻的日本血吸蟲序列131條,它們較高比例地齣現在正常童蟲高錶達的分子集類中;進一步文獻分析預測得到瞭52箇日本血吸蟲候選疫苗分子,它們的序列特徵與存在于血吸蟲體被的一些分子和已知的抗血吸蟲疫苗分子的相類似.用數據挖掘技術穫得瞭一批日本血吸蟲候選疫苗分子,為進一步實驗研究奠定瞭基礎.
예측료가능모의치약역묘면역보호성효과적일본혈흡충항원분자,위실험감정항일본혈흡충후선역묘분자제공기출.실험기우이발표적복조미유전화적동충적특정성전록본조(만씨혈흡충)화단백질조(일본혈흡충)서렬,용BLASTP산법등수심래원우정상일본혈흡충동충화성충적전록본조화단백질조중적서렬;응용재선연건、상관수거고급문헌대저사서렬진행서렬주석분석.결과획득료여복조미유전화적동충특정성표체적분자동원혹일치적일본혈흡충서렬131조,타문교고비례지출현재정상동충고표체적분자집류중;진일보문헌분석예측득도료52개일본혈흡충후선역묘분자,타문적서렬특정여존재우혈흡충체피적일사분자화이지적항혈흡충역묘분자적상유사.용수거알굴기술획득료일비일본혈흡충후선역묘분자,위진일보실험연구전정료기출.
