中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2012年
3期
270-273
,共4页
闭福银%谢艺红%谭毅%杨进业
閉福銀%謝藝紅%譚毅%楊進業
폐복은%사예홍%담의%양진업
乙型脑炎病毒%基因%种系发生
乙型腦炎病毒%基因%種繫髮生
을형뇌염병독%기인%충계발생
目的 对广西新分离乙脑病毒GP0722株进行全基因序列测定和分析,了解其基因组结构及毒力特征.方法 应用乙脑病毒全基因组扩增引物进行RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,拼接后得到全基因序列.应用Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1等生物软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析.结果 广西新分离乙脑病毒GP0722全基因长10 965个核苷酸,从97到10 395位编码一个开放阅读框,编码3 432个氨基酸,与目前使用的减毒活疫苗株SA-14-14-2株比较,只有88.9%的核苷酸同源性,97.6%的氨基酸同源性,全基因组共存在1 222个核苷酸差异,83个氨基酸差异.与GenBank中选择的21株乙脑病毒全基因序列比较发现,其核苷酸总体差异率为0.9%～18.8%,氨基酸总体差异率为0.1%～5.2%.通过PrM/C区段、E区段、3′NTR区段和全基因序列进行系统进化分析显示该毒株属于基因1型乙脑病毒.结论 新分离的乙脑病毒GP0722株属于基因1型,与JEV/sw/Mie/40/2004进化关系最近,与疫苗株SA-14-14-2相比关键位点氨基酸未见变异,现行使用的疫苗仍能保护GP0722引起的感染.
目的 對廣西新分離乙腦病毒GP0722株進行全基因序列測定和分析,瞭解其基因組結構及毒力特徵.方法 應用乙腦病毒全基因組擴增引物進行RT-PCR擴增,PCR產物直接測序,拼接後得到全基因序列.應用Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1等生物軟件進行覈苷痠序列及氨基痠序列分析和病毒的繫統進化分析.結果 廣西新分離乙腦病毒GP0722全基因長10 965箇覈苷痠,從97到10 395位編碼一箇開放閱讀框,編碼3 432箇氨基痠,與目前使用的減毒活疫苗株SA-14-14-2株比較,隻有88.9%的覈苷痠同源性,97.6%的氨基痠同源性,全基因組共存在1 222箇覈苷痠差異,83箇氨基痠差異.與GenBank中選擇的21株乙腦病毒全基因序列比較髮現,其覈苷痠總體差異率為0.9%～18.8%,氨基痠總體差異率為0.1%～5.2%.通過PrM/C區段、E區段、3′NTR區段和全基因序列進行繫統進化分析顯示該毒株屬于基因1型乙腦病毒.結論 新分離的乙腦病毒GP0722株屬于基因1型,與JEV/sw/Mie/40/2004進化關繫最近,與疫苗株SA-14-14-2相比關鍵位點氨基痠未見變異,現行使用的疫苗仍能保護GP0722引起的感染.
목적 대엄서신분리을뇌병독GP0722주진행전기인서렬측정화분석,료해기기인조결구급독력특정.방법 응용을뇌병독전기인조확증인물진행RT-PCR확증,PCR산물직접측서,병접후득도전기인서렬.응용Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1등생물연건진행핵감산서렬급안기산서렬분석화병독적계통진화분석.결과 엄서신분리을뇌병독GP0722전기인장10 965개핵감산,종97도10 395위편마일개개방열독광,편마3 432개안기산,여목전사용적감독활역묘주SA-14-14-2주비교,지유88.9%적핵감산동원성,97.6%적안기산동원성,전기인조공존재1 222개핵감산차이,83개안기산차이.여GenBank중선택적21주을뇌병독전기인서렬비교발현,기핵감산총체차이솔위0.9%～18.8%,안기산총체차이솔위0.1%～5.2%.통과PrM/C구단、E구단、3′NTR구단화전기인서렬진행계통진화분석현시해독주속우기인1형을뇌병독.결론 신분리적을뇌병독GP0722주속우기인1형,여JEV/sw/Mie/40/2004진화관계최근,여역묘주SA-14-14-2상비관건위점안기산미견변이,현행사용적역묘잉능보호GP0722인기적감염.
