基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2012年
1期
13-19
,共7页
张珍珍%李小溪%问亚琴%潘秋红
張珍珍%李小溪%問亞琴%潘鞦紅
장진진%리소계%문아금%반추홍
酿酒葡萄%分支酸合成酶(CS)%in silico克隆%基因表达
釀酒葡萄%分支痠閤成酶(CS)%in silico剋隆%基因錶達
양주포도%분지산합성매(CS)%in silico극륭%기인표체
本研究以酿酒葡萄(Vitis vinifera)品种赤霞珠(Cabernet Sauvignon)及霞多丽(Chardonnay)为试材,采用in silico克隆和分子克隆相结合的策略,从果实中克隆到分支酸合成酶基因,命名为VvCS.该基因的cDNA编码区全长1 312 bp,编码436个氨基酸残基,预测其编码蛋白质分子量为46.9 kD,等电点为7.8;生物信息学分析显示VvCS的DNA全长7 117 bp,包含13个外显子和12个内含子,定位于葡萄的第13号染色体上.VvCS编码的蛋白与其它植物来源的分支酸合成酶在氨基酸水平上的同源性为75%左右;实时荧光定量PCR分析表明VvCS在葡萄果实、茎、叶和叶柄组织中均有表达,且在果皮、果肉和种子中的表达变化趋势相似,与盛花后5周的果实相比,盛花后11周果实各部位中VvCS表达丰度均有不同程度增加.
本研究以釀酒葡萄(Vitis vinifera)品種赤霞珠(Cabernet Sauvignon)及霞多麗(Chardonnay)為試材,採用in silico剋隆和分子剋隆相結閤的策略,從果實中剋隆到分支痠閤成酶基因,命名為VvCS.該基因的cDNA編碼區全長1 312 bp,編碼436箇氨基痠殘基,預測其編碼蛋白質分子量為46.9 kD,等電點為7.8;生物信息學分析顯示VvCS的DNA全長7 117 bp,包含13箇外顯子和12箇內含子,定位于葡萄的第13號染色體上.VvCS編碼的蛋白與其它植物來源的分支痠閤成酶在氨基痠水平上的同源性為75%左右;實時熒光定量PCR分析錶明VvCS在葡萄果實、莖、葉和葉柄組織中均有錶達,且在果皮、果肉和種子中的錶達變化趨勢相似,與盛花後5週的果實相比,盛花後11週果實各部位中VvCS錶達豐度均有不同程度增加.
본연구이양주포도(Vitis vinifera)품충적하주(Cabernet Sauvignon)급하다려(Chardonnay)위시재,채용in silico극륭화분자극륭상결합적책략,종과실중극륭도분지산합성매기인,명명위VvCS.해기인적cDNA편마구전장1 312 bp,편마436개안기산잔기,예측기편마단백질분자량위46.9 kD,등전점위7.8;생물신식학분석현시VvCS적DNA전장7 117 bp,포함13개외현자화12개내함자,정위우포도적제13호염색체상.VvCS편마적단백여기타식물래원적분지산합성매재안기산수평상적동원성위75%좌우;실시형광정량PCR분석표명VvCS재포도과실、경、협화협병조직중균유표체,차재과피、과육화충자중적표체변화추세상사,여성화후5주적과실상비,성화후11주과실각부위중VvCS표체봉도균유불동정도증가.
