CAJ | 학술논문

利用IPI和GenBank,收集了与凋亡相关的5333条基因序列,用一定的标准,整合筛选得到1 384个凋亡相关的基因.通过亚细胞定位、组织表达差异显著性分析、自然正义/反义RNA对预测、基因簇在pathway上的定位、蛋白质/蛋白质相互作用等方面的分析发现,一些基因只在一个组织里显著差异表达,一些基因存在自然正义/反义RNA对现象,一些基因簇同时位于多条pathway等重要信息.同时,制作了一张凋亡相关基因的寡核苷酸芯片,并且对于一对NAIFl表达质粒转染前后的HeLa样品,通过该芯片的筛选,得到24个差异表达的基因.发现NAIFl过表达诱导的细胞凋亡,伴随了PAX2、PDCD8、PDCD10、DFFA、CASP7等基因表达的显著变化,同时还发现,U58668,该mRNA没有任何基因或蛋白质的注释信息,当camptothecin诱导U937细胞系凋亡时上调,在这里的NAIFl过表达诱导的HeLa细胞系中也上调(上述数据结果见http://gpcrome.cbj.pku.edu.cn:2005/chip).
이용IPI화GenBank,수집료여조망상관적5333조기인서렬,용일정적표준,정합사선득도1 384개조망상관적기인.통과아세포정위、조직표체차이현저성분석、자연정의/반의RNA대예측、기인족재pathway상적정위、단백질/단백질상호작용등방면적분석발현,일사기인지재일개조직리현저차이표체,일사기인존재자연정의/반의RNA대현상,일사기인족동시위우다조pathway등중요신식.동시,제작료일장조망상관기인적과핵감산심편,병차대우일대NAIFl표체질립전염전후적HeLa양품,통과해심편적사선,득도24개차이표체적기인.발현NAIFl과표체유도적세포조망,반수료PAX2、PDCD8、PDCD10、DFFA、CASP7등기인표체적현저변화,동시환발현,U58668,해mRNA몰유임하기인혹단백질적주석신식,당camptothecin유도U937세포계조망시상조,재저리적NAIFl과표체유도적HeLa세포계중야상조(상술수거결과견http://gpcrome.cbj.pku.edu.cn:2005/chip).