浙江大学学报（医学版）
浙江大學學報（醫學版）
절강대학학보（의학판）
JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY MEDICAL SCIENCES
2007年
6期
531-536
,共6页
曹清毅%侯晓丽%吴昊%陈智
曹清毅%侯曉麗%吳昊%陳智
조청의%후효려%오호%진지
细菌%基因%鉴别%系统发育树%gyrB基因%BLAST%序列分析
細菌%基因%鑒彆%繫統髮育樹%gyrB基因%BLAST%序列分析
세균%기인%감별%계통발육수%gyrB기인%BLAST%서렬분석
目的:以gyrB基因序列为基础,采用系统发育分析方法构建进化树,对种系关系密切的病原菌进行区分鉴别.方法:测序获得本地区19株大肠埃希菌、13株志贺菌、2株豚鼠气单胞菌、2株嗜水气单胞菌、1株维隆气单胞菌的gyrB基因序列,并将其同公共数据库已有序列合并,构建进化树.分析各序列在树中的聚类关系,以此对菌株进行种水平分类鉴别,并同BLAST查询结果相比较.结果:除鲍氏和痢疾志贺菌外,对检测的所有序列,在进化树上与之最邻近的5条序列均为该种菌株.而对一部分菌株,其BLAST查询结果中含有其它菌种的或分类关系不明确的序列.结论:以系统发育方法对种系发生关系密切的病原菌序列进行鉴别,具有较好的分辨力和准确度.
目的:以gyrB基因序列為基礎,採用繫統髮育分析方法構建進化樹,對種繫關繫密切的病原菌進行區分鑒彆.方法:測序穫得本地區19株大腸埃希菌、13株誌賀菌、2株豚鼠氣單胞菌、2株嗜水氣單胞菌、1株維隆氣單胞菌的gyrB基因序列,併將其同公共數據庫已有序列閤併,構建進化樹.分析各序列在樹中的聚類關繫,以此對菌株進行種水平分類鑒彆,併同BLAST查詢結果相比較.結果:除鮑氏和痢疾誌賀菌外,對檢測的所有序列,在進化樹上與之最鄰近的5條序列均為該種菌株.而對一部分菌株,其BLAST查詢結果中含有其它菌種的或分類關繫不明確的序列.結論:以繫統髮育方法對種繫髮生關繫密切的病原菌序列進行鑒彆,具有較好的分辨力和準確度.
목적:이gyrB기인서렬위기출,채용계통발육분석방법구건진화수,대충계관계밀절적병원균진행구분감별.방법:측서획득본지구19주대장애희균、13주지하균、2주돈서기단포균、2주기수기단포균、1주유륭기단포균적gyrB기인서렬,병장기동공공수거고이유서렬합병,구건진화수.분석각서렬재수중적취류관계,이차대균주진행충수평분류감별,병동BLAST사순결과상비교.결과:제포씨화이질지하균외,대검측적소유서렬,재진화수상여지최린근적5조서렬균위해충균주.이대일부분균주,기BLAST사순결과중함유기타균충적혹분류관계불명학적서렬.결론:이계통발육방법대충계발생관계밀절적병원균서렬진행감별,구유교호적분변력화준학도.
