化学学报
化學學報
화학학보
ACTA CHIMICA SINICA
2000年
3期
313-318
,共6页
侯廷军%安钰%李有勇%茹炳根%毕汝昌%徐筱杰
侯廷軍%安鈺%李有勇%茹炳根%畢汝昌%徐篠傑
후정군%안옥%리유용%여병근%필여창%서소걸
金属硫蛋白%静电势%同源蛋白模型搭建
金屬硫蛋白%靜電勢%同源蛋白模型搭建
금속류단백%정전세%동원단백모형탑건
考察了三种金属硫蛋白(大鼠金属硫蛋白亚型Ⅱ,兔肝金属硫蛋白亚型Ⅰ和兔肝金属硫蛋白亚型Ⅱ)的单体、二聚体和三聚体在pH为5.6～8.5和10.6两种缓冲条件下的静电势分布.其中大鼠金属硫蛋白亚型Ⅱ的结构直接来自于晶体数据,兔肝金属硫蛋白亚型Ⅰ和Ⅱ的结构则通过同源蛋白模型搭建.三种金属硫蛋白的静电势通过有限差分方法求解Poisson-Boltzmann方程得到.对于三种金属硫蛋白的二聚体,pH为5.6～8.5时,单体和单体之间的静电势分布具有明显的互补性;但pH≥10.6时,这种互补性会大大削弱.对于三种金属硫蛋白的三聚体,单体和二聚体之间主要表现为静电排斥,而且pH在10.6下的静电排斥力明显强于pH为5.6～8.5时的静电排斥.
攷察瞭三種金屬硫蛋白(大鼠金屬硫蛋白亞型Ⅱ,兔肝金屬硫蛋白亞型Ⅰ和兔肝金屬硫蛋白亞型Ⅱ)的單體、二聚體和三聚體在pH為5.6～8.5和10.6兩種緩遲條件下的靜電勢分佈.其中大鼠金屬硫蛋白亞型Ⅱ的結構直接來自于晶體數據,兔肝金屬硫蛋白亞型Ⅰ和Ⅱ的結構則通過同源蛋白模型搭建.三種金屬硫蛋白的靜電勢通過有限差分方法求解Poisson-Boltzmann方程得到.對于三種金屬硫蛋白的二聚體,pH為5.6～8.5時,單體和單體之間的靜電勢分佈具有明顯的互補性;但pH≥10.6時,這種互補性會大大削弱.對于三種金屬硫蛋白的三聚體,單體和二聚體之間主要錶現為靜電排斥,而且pH在10.6下的靜電排斥力明顯彊于pH為5.6～8.5時的靜電排斥.
고찰료삼충금속류단백(대서금속류단백아형Ⅱ,토간금속류단백아형Ⅰ화토간금속류단백아형Ⅱ)적단체、이취체화삼취체재pH위5.6～8.5화10.6량충완충조건하적정전세분포.기중대서금속류단백아형Ⅱ적결구직접래자우정체수거,토간금속류단백아형Ⅰ화Ⅱ적결구칙통과동원단백모형탑건.삼충금속류단백적정전세통과유한차분방법구해Poisson-Boltzmann방정득도.대우삼충금속류단백적이취체,pH위5.6～8.5시,단체화단체지간적정전세분포구유명현적호보성;단pH≥10.6시,저충호보성회대대삭약.대우삼충금속류단백적삼취체,단체화이취체지간주요표현위정전배척,이차pH재10.6하적정전배척력명현강우pH위5.6～8.5시적정전배척.
