中国农业科技导报
中國農業科技導報
중국농업과기도보
REVIEW OF CHINA AGRICULTURAL SCIENCE AND TECHNOLOGY
2009年
1期
73-79
,共7页
何夙旭%周志刚%姚斌%白东清
何夙旭%週誌剛%姚斌%白東清
하숙욱%주지강%요빈%백동청
养殖池塘%菌群%PCR-DGGE
養殖池塘%菌群%PCR-DGGE
양식지당%균군%PCR-DGGE
比较3种DNA提取方法(溶菌酶法、CTAB法及珠磨法)对养殖池塘几种生境(底泥、饲料、草鱼肠道内容物及肠道壁)菌群PCR-DGGE分析的影响.结果表明,以3种提取方法获得的DNA为馍饭均能进行16SrDNA V3区特异性片段扩增;但不同DNA提取方法对池塘不同生境菌群DGGE指纹图谱存在显著影响.DGGE指纹图潜显示草鱼肠道内容物菌群(溶菌酶法)与肠道壁菌群(溶菌酶法)存在较高一致性,底泥菌群(CTAB法)及饲料菌群(溶菌酶法)与鱼体肠道菌群(包括内容物菌群和肠道壁菌群)则存在日明显差异,但肠道菌群与底泥菌群的相似度相对更高.研究提示采用微生物分子生态学工具对养殖池塘小同生境进行菌群结构分析时,需提前优化DNA提取方法;在以投饲为主的养殖鱼塘中,草鱼肠道菌群更多源自于池塘底泥.
比較3種DNA提取方法(溶菌酶法、CTAB法及珠磨法)對養殖池塘幾種生境(底泥、飼料、草魚腸道內容物及腸道壁)菌群PCR-DGGE分析的影響.結果錶明,以3種提取方法穫得的DNA為饃飯均能進行16SrDNA V3區特異性片段擴增;但不同DNA提取方法對池塘不同生境菌群DGGE指紋圖譜存在顯著影響.DGGE指紋圖潛顯示草魚腸道內容物菌群(溶菌酶法)與腸道壁菌群(溶菌酶法)存在較高一緻性,底泥菌群(CTAB法)及飼料菌群(溶菌酶法)與魚體腸道菌群(包括內容物菌群和腸道壁菌群)則存在日明顯差異,但腸道菌群與底泥菌群的相似度相對更高.研究提示採用微生物分子生態學工具對養殖池塘小同生境進行菌群結構分析時,需提前優化DNA提取方法;在以投飼為主的養殖魚塘中,草魚腸道菌群更多源自于池塘底泥.
비교3충DNA제취방법(용균매법、CTAB법급주마법)대양식지당궤충생경(저니、사료、초어장도내용물급장도벽)균군PCR-DGGE분석적영향.결과표명,이3충제취방법획득적DNA위막반균능진행16SrDNA V3구특이성편단확증;단불동DNA제취방법대지당불동생경균군DGGE지문도보존재현저영향.DGGE지문도잠현시초어장도내용물균군(용균매법)여장도벽균군(용균매법)존재교고일치성,저니균군(CTAB법)급사료균군(용균매법)여어체장도균군(포괄내용물균군화장도벽균군)칙존재일명현차이,단장도균군여저니균군적상사도상대경고.연구제시채용미생물분자생태학공구대양식지당소동생경진행균군결구분석시,수제전우화DNA제취방법;재이투사위주적양식어당중,초어장도균군경다원자우지당저니.
