上海大学学报（自然科学版）
上海大學學報（自然科學版）
상해대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE EDITION)
2010年
4期
397-403,435
,共8页
植物miRNA%MiRfilter%毛果杨基因组%一类分类法%K-最近邻分类器(KNN)
植物miRNA%MiRfilter%毛果楊基因組%一類分類法%K-最近鄰分類器(KNN)
식물miRNA%MiRfilter%모과양기인조%일류분류법%K-최근린분류기(KNN)
从参数训练、参数范围训练、候选成熟体打分等方面改进miRNA预测系统MiRfilter,使其适应拥有更长前体的植物miRNA的预测.预测毛果杨基因组上的miRNA,并对系统进行精度检验.利用MiRfilter系统共预测出3 860条候选miRNA;在110个正样本中,正确识别91条前体和80条成熟体,前体预测精度为82.73%,成熟体预测精度为72.73%;在毛果杨第4号染色体(LG_Ⅳ)上得到的1 968个负样本中,有12个数据可认为是miRNA,假阳性率为0.61%.
從參數訓練、參數範圍訓練、候選成熟體打分等方麵改進miRNA預測繫統MiRfilter,使其適應擁有更長前體的植物miRNA的預測.預測毛果楊基因組上的miRNA,併對繫統進行精度檢驗.利用MiRfilter繫統共預測齣3 860條候選miRNA;在110箇正樣本中,正確識彆91條前體和80條成熟體,前體預測精度為82.73%,成熟體預測精度為72.73%;在毛果楊第4號染色體(LG_Ⅳ)上得到的1 968箇負樣本中,有12箇數據可認為是miRNA,假暘性率為0.61%.
종삼수훈련、삼수범위훈련、후선성숙체타분등방면개진miRNA예측계통MiRfilter,사기괄응옹유경장전체적식물miRNA적예측.예측모과양기인조상적miRNA,병대계통진행정도검험.이용MiRfilter계통공예측출3 860조후선miRNA;재110개정양본중,정학식별91조전체화80조성숙체,전체예측정도위82.73%,성숙체예측정도위72.73%;재모과양제4호염색체(LG_Ⅳ)상득도적1 968개부양본중,유12개수거가인위시miRNA,가양성솔위0.61%.
