华南农业大学学报
華南農業大學學報
화남농업대학학보
JOURNAL OF SOUTH CHINA AGRICULTURAL UNIVERSITY
2012年
1期
92-95
,共4页
单晓枫%吴同垒%孟庆峰%王伟利%钱爱东
單曉楓%吳同壘%孟慶峰%王偉利%錢愛東
단효풍%오동루%맹경봉%왕위리%전애동
框镜鲤%维氏气单胞菌%flaA基因%生物信息学
框鏡鯉%維氏氣單胞菌%flaA基因%生物信息學
광경리%유씨기단포균%flaA기인%생물신식학
以框镜鲤Cyprinus carpio维氏气单胞菌Aeromonas veronii CY0806株细菌基因组DNA为模板,经PCR扩增,获得flaA基因,将其克隆并测序,测序结果与气单胞菌属的不同菌株进行相似性分析,并对flaA基因编码蛋白质进行生物信息学分析.结果显示:获得框镜鲤维氏气单胞菌鞭毛flaA基因,长915 bp,编码304个氨基酸,系统进化树分析,其与其他维氏气单胞菌flaA基因处于同一分支,相关生物信息学分析显示,flaA基因编码的蛋白质相对分子质量32 098.66,等电点5.57,半衰期30 h,不稳定系数为32.31,脂肪系数81.05,不存在信号肽和跨膜区,二级结构预测:flaA基因以α螺旋和β折叠为主,同时,以同源建模法预测了flaA基因编码蛋白的三维立体结构.
以框鏡鯉Cyprinus carpio維氏氣單胞菌Aeromonas veronii CY0806株細菌基因組DNA為模闆,經PCR擴增,穫得flaA基因,將其剋隆併測序,測序結果與氣單胞菌屬的不同菌株進行相似性分析,併對flaA基因編碼蛋白質進行生物信息學分析.結果顯示:穫得框鏡鯉維氏氣單胞菌鞭毛flaA基因,長915 bp,編碼304箇氨基痠,繫統進化樹分析,其與其他維氏氣單胞菌flaA基因處于同一分支,相關生物信息學分析顯示,flaA基因編碼的蛋白質相對分子質量32 098.66,等電點5.57,半衰期30 h,不穩定繫數為32.31,脂肪繫數81.05,不存在信號肽和跨膜區,二級結構預測:flaA基因以α螺鏇和β摺疊為主,同時,以同源建模法預測瞭flaA基因編碼蛋白的三維立體結構.
이광경리Cyprinus carpio유씨기단포균Aeromonas veronii CY0806주세균기인조DNA위모판,경PCR확증,획득flaA기인,장기극륭병측서,측서결과여기단포균속적불동균주진행상사성분석,병대flaA기인편마단백질진행생물신식학분석.결과현시:획득광경리유씨기단포균편모flaA기인,장915 bp,편마304개안기산,계통진화수분석,기여기타유씨기단포균flaA기인처우동일분지,상관생물신식학분석현시,flaA기인편마적단백질상대분자질량32 098.66,등전점5.57,반쇠기30 h,불은정계수위32.31,지방계수81.05,불존재신호태화과막구,이급결구예측:flaA기인이α라선화β절첩위주,동시,이동원건모법예측료flaA기인편마단백적삼유입체결구.
