CAJ | 학술논문

利用RT-PCR方法,首次从毛白杨成熟木质部cDNA文库中分离出PtSUS1 cDNA全长,并进行了测序和序列分析.结果表明:克隆的毛白杨PtSUS1 cDNA片段总长为2 703 bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为2 415 bp,可编码长度为805个氨基酸残基的蛋白质,所推导的蛋白质氨基酸序列与拟南芥AtSUSl、水稻OsSUS1的蛋白质氨基酸序列同源性分别为83.4%,75.7%.组织特异性Realtime-PCR结果显示,PtSUS1在成熟木质部表达丰度最高,在成熟叶片、根部和正在发育的木质部表达丰度中等,在韧皮部和形成层有少量表达,在嫩叶与顶端分生组织中表达丰度最低.在此基础上,组合利用MEGA4.0和DnaSP4.50.4软件对毛白杨40株基因型个体的PtSUSl序列进行比对和分析,共检测到235个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率为1/25 bp,多样性指数π为0.009 24.在外显子区域,共检测到66个SNP位点,其中55个为同义突变,10个为错义突变,1个为无义突变.在编码区内,非同义突变与同义突变的比率<1,这一结果显示在毛白杨物种演化过程中,纯化选择是PtSUS1基因内同义SNP位点主要的进化驱动力.
이용RT-PCR방법,수차종모백양성숙목질부cDNA문고중분리출PtSUS1 cDNA전장,병진행료측서화서렬분석.결과표명:극륭적모백양PtSUS1 cDNA편단총장위2 703 bp,기인내부함유완정적개방열독광가,대소위2 415 bp,가편마장도위805개안기산잔기적단백질,소추도적단백질안기산서렬여의남개AtSUSl、수도OsSUS1적단백질안기산서렬동원성분별위83.4%,75.7%.조직특이성Realtime-PCR결과현시,PtSUS1재성숙목질부표체봉도최고,재성숙협편、근부화정재발육적목질부표체봉도중등,재인피부화형성층유소량표체,재눈협여정단분생조직중표체봉도최저.재차기출상,조합이용MEGA4.0화DnaSP4.50.4연건대모백양40주기인형개체적PtSUSl서렬진행비대화분석,공검측도235개단핵감산다태성(SNP)위점,SNP빈솔위1/25 bp,다양성지수π위0.009 24.재외현자구역,공검측도66개SNP위점,기중55개위동의돌변,10개위착의돌변,1개위무의돌변.재편마구내,비동의돌변여동의돌변적비솔<1,저일결과현시재모백양물충연화과정중,순화선택시PtSUS1기인내동의SNP위점주요적진화구동력.