植物病理学报
植物病理學報
식물병이학보
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA
2007年
4期
383-389
,共7页
芜菁花叶病毒%HC-Pro基因%序列分析
蕪菁花葉病毒%HC-Pro基因%序列分析
무정화협병독%HC-Pro기인%서렬분석
16个芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)欧亚分离物分别来自奥地利、丹麦、德国、匈牙利、尼泊尔和英国6国.利用免疫捕获反转录PCR(Immunocapture RT-PCR,IC-RT-PCR)对16个分离物的HC-Pro(Helper component proteinase)基因进行PCR扩增,扩增产物克隆后进行序列测定,HC-Pro基因序列长度均为1 374个核苷酸,编码458个氨基酸.16个分离物的HC-Pro基因核苷酸序列同源性为79.5%～90.8%,所编码的氨基酸同源性为94.1%～99.8%.对16个分离物及GenBank上已报道的其它14个TuMV的HC-Pro基因核苷酸的系统进化树分析表明:在16个TuMV欧亚分离物中,除了来自亚洲的分离物N23属Asian-BR组,其余15个来自欧洲的分离物都属于world-B组,其中分离物H1归属world-wide亚组,另外14个分离物则归属New World亚组.
16箇蕪菁花葉病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)歐亞分離物分彆來自奧地利、丹麥、德國、匈牙利、尼泊爾和英國6國.利用免疫捕穫反轉錄PCR(Immunocapture RT-PCR,IC-RT-PCR)對16箇分離物的HC-Pro(Helper component proteinase)基因進行PCR擴增,擴增產物剋隆後進行序列測定,HC-Pro基因序列長度均為1 374箇覈苷痠,編碼458箇氨基痠.16箇分離物的HC-Pro基因覈苷痠序列同源性為79.5%～90.8%,所編碼的氨基痠同源性為94.1%～99.8%.對16箇分離物及GenBank上已報道的其它14箇TuMV的HC-Pro基因覈苷痠的繫統進化樹分析錶明:在16箇TuMV歐亞分離物中,除瞭來自亞洲的分離物N23屬Asian-BR組,其餘15箇來自歐洲的分離物都屬于world-B組,其中分離物H1歸屬world-wide亞組,另外14箇分離物則歸屬New World亞組.
16개무정화협병독(Turnip mosaic virus,TuMV)구아분리물분별래자오지리、단맥、덕국、흉아리、니박이화영국6국.이용면역포획반전록PCR(Immunocapture RT-PCR,IC-RT-PCR)대16개분리물적HC-Pro(Helper component proteinase)기인진행PCR확증,확증산물극륭후진행서렬측정,HC-Pro기인서렬장도균위1 374개핵감산,편마458개안기산.16개분리물적HC-Pro기인핵감산서렬동원성위79.5%～90.8%,소편마적안기산동원성위94.1%～99.8%.대16개분리물급GenBank상이보도적기타14개TuMV적HC-Pro기인핵감산적계통진화수분석표명:재16개TuMV구아분리물중,제료래자아주적분리물N23속Asian-BR조,기여15개래자구주적분리물도속우world-B조,기중분리물H1귀속world-wide아조,령외14개분리물칙귀속New World아조.
