中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
24期
194-200
,共7页
冯潜%弄庆媛%麦秀英%周虹%陈劲松%周嘉裕%廖海
馮潛%弄慶媛%麥秀英%週虹%陳勁鬆%週嘉裕%廖海
풍잠%롱경원%맥수영%주홍%진경송%주가유%료해
生物信息学%胆碱单氧化酶%GenBank%抗逆
生物信息學%膽堿單氧化酶%GenBank%抗逆
생물신식학%담감단양화매%GenBank%항역
为了研究胆碱单氧化物酶的抗逆机理,运用NCBI、Expasy、Psort、NetPhosK、TMHMM、NPSA网站和MEGA5、DNAman软件,对已在GenBank数据库中注册中的甜菜、菠菜、四翅滨藜草、山菠菜、苋菜等植物胆碱单氧化酶的氨基酸序列进行生物信息学分析.结果表明:植物胆碱单氧化酶中Ala、Ser、Leu等氨基酸含量较丰富,属于稳定蛋白;不同植物胆碱单氧化酶的氨基酸序列具有较高的同源性(81.52％),均含有转运肽区、2Fe-S中心区和非血红素Fe离子结合区;分子进化树揭示胆碱单氧化酶有较强的保守性,可作为植物遗传分化和分子进化研究的重要依据;分子中不存在跨膜结构域,与疏水区域预测结果一致;可能受蛋白激酶C磷酸化,位点为Ser326;无规卷曲是多肽链中大量的结构元件;包含2个功能结构域,分属于Rieske家族与SRPBCC家族.本研究结果为开展胆碱单氧化酶的酶学特性及甘氨酸甜菜碱生物合成的分子机理研究提供理论参考.
為瞭研究膽堿單氧化物酶的抗逆機理,運用NCBI、Expasy、Psort、NetPhosK、TMHMM、NPSA網站和MEGA5、DNAman軟件,對已在GenBank數據庫中註冊中的甜菜、菠菜、四翅濱藜草、山菠菜、莧菜等植物膽堿單氧化酶的氨基痠序列進行生物信息學分析.結果錶明:植物膽堿單氧化酶中Ala、Ser、Leu等氨基痠含量較豐富,屬于穩定蛋白;不同植物膽堿單氧化酶的氨基痠序列具有較高的同源性(81.52％),均含有轉運肽區、2Fe-S中心區和非血紅素Fe離子結閤區;分子進化樹揭示膽堿單氧化酶有較彊的保守性,可作為植物遺傳分化和分子進化研究的重要依據;分子中不存在跨膜結構域,與疏水區域預測結果一緻;可能受蛋白激酶C燐痠化,位點為Ser326;無規捲麯是多肽鏈中大量的結構元件;包含2箇功能結構域,分屬于Rieske傢族與SRPBCC傢族.本研究結果為開展膽堿單氧化酶的酶學特性及甘氨痠甜菜堿生物閤成的分子機理研究提供理論參攷.
위료연구담감단양화물매적항역궤리,운용NCBI、Expasy、Psort、NetPhosK、TMHMM、NPSA망참화MEGA5、DNAman연건,대이재GenBank수거고중주책중적첨채、파채、사시빈려초、산파채、현채등식물담감단양화매적안기산서렬진행생물신식학분석.결과표명:식물담감단양화매중Ala、Ser、Leu등안기산함량교봉부,속우은정단백;불동식물담감단양화매적안기산서렬구유교고적동원성(81.52％),균함유전운태구、2Fe-S중심구화비혈홍소Fe리자결합구;분자진화수게시담감단양화매유교강적보수성,가작위식물유전분화화분자진화연구적중요의거;분자중불존재과막결구역,여소수구역예측결과일치;가능수단백격매C린산화,위점위Ser326;무규권곡시다태련중대량적결구원건;포함2개공능결구역,분속우Rieske가족여SRPBCC가족.본연구결과위개전담감단양화매적매학특성급감안산첨채감생물합성적분자궤리연구제공이론삼고.
