微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2006年
6期
1003-1006
,共4页
杨灵勇%汪志平%曹学成%陈晓燕%徐步进%李雪斌%黄晖
楊靈勇%汪誌平%曹學成%陳曉燕%徐步進%李雪斌%黃暉
양령용%왕지평%조학성%진효연%서보진%리설빈%황휘
节旋藻%cpcHID操纵子%16S rRNA%16S-23S rRNA ITS%分类
節鏇藻%cpcHID操縱子%16S rRNA%16S-23S rRNA ITS%分類
절선조%cpcHID조종자%16S rRNA%16S-23S rRNA ITS%분류
克隆并测定7株钝顶节旋藻品系的cpcHID操纵子序列,以及16S rRNA和16S-23S rRNA转录单元内间隔区(ITS)序列,进一步通过生物信息学和分子系统学等研究发现:(1) 7株品系的cpcHID序列,以及16S rRNA和ITS序列具有很高的相似性.(2) 基于7株品系cpcHID序列的GC含量绝对偏差平均值、碱基变异率和遗传距离系数普遍比基于16S rRNA和ITS序列的大.(3) 基于cpcHID序列的分类结果与基于16S rRNA和ITS序列的十分相近.因此,cpcHID可作为节旋藻等蓝细菌分类与鉴定的一种新的分子标记,特别是以其丰富的信息量而在品系水平的分类鉴定中占有优势.
剋隆併測定7株鈍頂節鏇藻品繫的cpcHID操縱子序列,以及16S rRNA和16S-23S rRNA轉錄單元內間隔區(ITS)序列,進一步通過生物信息學和分子繫統學等研究髮現:(1) 7株品繫的cpcHID序列,以及16S rRNA和ITS序列具有很高的相似性.(2) 基于7株品繫cpcHID序列的GC含量絕對偏差平均值、堿基變異率和遺傳距離繫數普遍比基于16S rRNA和ITS序列的大.(3) 基于cpcHID序列的分類結果與基于16S rRNA和ITS序列的十分相近.因此,cpcHID可作為節鏇藻等藍細菌分類與鑒定的一種新的分子標記,特彆是以其豐富的信息量而在品繫水平的分類鑒定中佔有優勢.
극륭병측정7주둔정절선조품계적cpcHID조종자서렬,이급16S rRNA화16S-23S rRNA전록단원내간격구(ITS)서렬,진일보통과생물신식학화분자계통학등연구발현:(1) 7주품계적cpcHID서렬,이급16S rRNA화ITS서렬구유흔고적상사성.(2) 기우7주품계cpcHID서렬적GC함량절대편차평균치、감기변이솔화유전거리계수보편비기우16S rRNA화ITS서렬적대.(3) 기우cpcHID서렬적분류결과여기우16S rRNA화ITS서렬적십분상근.인차,cpcHID가작위절선조등람세균분류여감정적일충신적분자표기,특별시이기봉부적신식량이재품계수평적분류감정중점유우세.
