中国兽医科学
中國獸醫科學
중국수의과학
VETERINARY SCIENCE IN CHINA
2008年
12期
1025-1032
,共8页
新城疫病毒%野毒%疫苗%区分%诊断%软件%开发
新城疫病毒%野毒%疫苗%區分%診斷%軟件%開髮
신성역병독%야독%역묘%구분%진단%연건%개발
运用生物信息学软件对GenBank中收录的30株新城疫病毒(NDV)全基因组序列间的差异和它们对应的F基因片段22～420核苷酸序列间的差异进行了分析.发现这些差异高度相关(r=0.937),该片段可作为区分NDV野毒和疫苗毒的指纹序列.据此设计了1对扩增用简并引物(其中一条用于PCR产物的直接测序),建立了RT-PCR-测序技术.并测得2个参数:NDV标准疫苗指纹序列库和指纹序列的变异参数.在此基础上,开发出多功能自动分析软件,通过对该指纹序列的分析,不仅可以区分NDV疫苗毒和野毒,还能同步测定这些病毒的毒力和基因型.该技术对NDV标准毒株的测定结果与已知信息完全吻合,且只需3 d即可获得结果.对不同禽类(鹅、鸽、鸵鸟、鸡)中分离的NDV的测定结果表明,59%为残留的疫苗毒.
運用生物信息學軟件對GenBank中收錄的30株新城疫病毒(NDV)全基因組序列間的差異和它們對應的F基因片段22～420覈苷痠序列間的差異進行瞭分析.髮現這些差異高度相關(r=0.937),該片段可作為區分NDV野毒和疫苗毒的指紋序列.據此設計瞭1對擴增用簡併引物(其中一條用于PCR產物的直接測序),建立瞭RT-PCR-測序技術.併測得2箇參數:NDV標準疫苗指紋序列庫和指紋序列的變異參數.在此基礎上,開髮齣多功能自動分析軟件,通過對該指紋序列的分析,不僅可以區分NDV疫苗毒和野毒,還能同步測定這些病毒的毒力和基因型.該技術對NDV標準毒株的測定結果與已知信息完全吻閤,且隻需3 d即可穫得結果.對不同禽類(鵝、鴿、鴕鳥、鷄)中分離的NDV的測定結果錶明,59%為殘留的疫苗毒.
운용생물신식학연건대GenBank중수록적30주신성역병독(NDV)전기인조서렬간적차이화타문대응적F기인편단22～420핵감산서렬간적차이진행료분석.발현저사차이고도상관(r=0.937),해편단가작위구분NDV야독화역묘독적지문서렬.거차설계료1대확증용간병인물(기중일조용우PCR산물적직접측서),건립료RT-PCR-측서기술.병측득2개삼수:NDV표준역묘지문서렬고화지문서렬적변이삼수.재차기출상,개발출다공능자동분석연건,통과대해지문서렬적분석,불부가이구분NDV역묘독화야독,환능동보측정저사병독적독력화기인형.해기술대NDV표준독주적측정결과여이지신식완전문합,차지수3 d즉가획득결과.대불동금류(아、합、타조、계)중분리적NDV적측정결과표명,59%위잔류적역묘독.
