武汉植物学研究
武漢植物學研究
무한식물학연구
JOURNAL OF WUHAN BOTANICAL RESEARCH
2009年
4期
432-436
,共5页
边春象%李劲涛%彭正松%阮期平
邊春象%李勁濤%彭正鬆%阮期平
변춘상%리경도%팽정송%원기평
细胞色素C%蛇苔%序列%功能预测
細胞色素C%蛇苔%序列%功能預測
세포색소C%사태%서렬%공능예측
通过核酸序列比对,在蛇苔cDNA文库中获得细胞色素C(Cyt C)基因序列,并对其编码的蛋白质产物从同源性、氨基酸组成、理化性质、亚细胞位点、结构和功能等进行生物信息学分析和预测.结果表明,该cDNA序列具有完整的开放阅读框(ORF,104~442 bp),推测编码蛋白为112个氨基酸,与向日葵、荞麦、玉米等Cyt C存在着较高的保守性(相似性分别为84%、85%和84%),同属于细胞色素C超家族;蛇苔Cyt C蛋白的分子量为 11998.7 Da,不含信号肽,成熟的Cyt C起始于Ala2,其活性位点为Cys23、Cys26、His27和Met89;对蛋白质的翻译后修饰预测表明Ala2存在乙酰化修饰,Lys81和Lys95分别进行三甲基赖氨酸修饰.这些特点与其他植物Cyt C保持一致,表明该基因为蛇苔cyt c基因,在进化上相对保守.
通過覈痠序列比對,在蛇苔cDNA文庫中穫得細胞色素C(Cyt C)基因序列,併對其編碼的蛋白質產物從同源性、氨基痠組成、理化性質、亞細胞位點、結構和功能等進行生物信息學分析和預測.結果錶明,該cDNA序列具有完整的開放閱讀框(ORF,104~442 bp),推測編碼蛋白為112箇氨基痠,與嚮日葵、蕎麥、玉米等Cyt C存在著較高的保守性(相似性分彆為84%、85%和84%),同屬于細胞色素C超傢族;蛇苔Cyt C蛋白的分子量為 11998.7 Da,不含信號肽,成熟的Cyt C起始于Ala2,其活性位點為Cys23、Cys26、His27和Met89;對蛋白質的翻譯後脩飾預測錶明Ala2存在乙酰化脩飾,Lys81和Lys95分彆進行三甲基賴氨痠脩飾.這些特點與其他植物Cyt C保持一緻,錶明該基因為蛇苔cyt c基因,在進化上相對保守.
통과핵산서렬비대,재사태cDNA문고중획득세포색소C(Cyt C)기인서렬,병대기편마적단백질산물종동원성、안기산조성、이화성질、아세포위점、결구화공능등진행생물신식학분석화예측.결과표명,해cDNA서렬구유완정적개방열독광(ORF,104~442 bp),추측편마단백위112개안기산,여향일규、교맥、옥미등Cyt C존재착교고적보수성(상사성분별위84%、85%화84%),동속우세포색소C초가족;사태Cyt C단백적분자량위 11998.7 Da,불함신호태,성숙적Cyt C기시우Ala2,기활성위점위Cys23、Cys26、His27화Met89;대단백질적번역후수식예측표명Ala2존재을선화수식,Lys81화Lys95분별진행삼갑기뢰안산수식.저사특점여기타식물Cyt C보지일치,표명해기인위사태cyt c기인,재진화상상대보수.