华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2012年
4期
60-64
,共5页
晁岳恩%常阳%王美芳%何盛莲%赵献林%雷振生
晁嶽恩%常暘%王美芳%何盛蓮%趙獻林%雷振生
조악은%상양%왕미방%하성련%조헌림%뢰진생
作物%叶绿体基因%密码子偏好性%聚类分析
作物%葉綠體基因%密碼子偏好性%聚類分析
작물%협록체기인%밀마자편호성%취류분석
研究作物叶绿体蛋白编码基因的编码特点,对指导农作物的叶绿体基因工程研究设计,促进外源基因在受体作物中的高效、稳定表达具有重要作用.为此,综合运用了多种分析软件,对7种大田作物的叶绿体蛋白编码基因进行分析.结果表明:叶绿体蛋白编码基因的总碱基构成在7种作物中差异不大,都是A含量最高,而G,C的含量较低；但在密码子第3位的碱基构成上却有明显差别,3种双子叶作物偏爱以C,T结尾的密码子,而禾本科的4种作物则偏爱以T,C结尾的密码子；RSCU(同义密码子的相对使用度)值显示出禾本科作物有26个密码子具有偏好性,而双子叶作物有25个密码子具有偏好性,但二者之间有22个相同的偏好性密码子.基于RSCU值的聚类结果显示,植物的密码子偏好性具有种族特征,表明基于叶绿体蛋白编码基因的密码子使用特性的聚类结果可以作为系统发育分析的重要补充.
研究作物葉綠體蛋白編碼基因的編碼特點,對指導農作物的葉綠體基因工程研究設計,促進外源基因在受體作物中的高效、穩定錶達具有重要作用.為此,綜閤運用瞭多種分析軟件,對7種大田作物的葉綠體蛋白編碼基因進行分析.結果錶明:葉綠體蛋白編碼基因的總堿基構成在7種作物中差異不大,都是A含量最高,而G,C的含量較低；但在密碼子第3位的堿基構成上卻有明顯差彆,3種雙子葉作物偏愛以C,T結尾的密碼子,而禾本科的4種作物則偏愛以T,C結尾的密碼子；RSCU(同義密碼子的相對使用度)值顯示齣禾本科作物有26箇密碼子具有偏好性,而雙子葉作物有25箇密碼子具有偏好性,但二者之間有22箇相同的偏好性密碼子.基于RSCU值的聚類結果顯示,植物的密碼子偏好性具有種族特徵,錶明基于葉綠體蛋白編碼基因的密碼子使用特性的聚類結果可以作為繫統髮育分析的重要補充.
연구작물협록체단백편마기인적편마특점,대지도농작물적협록체기인공정연구설계,촉진외원기인재수체작물중적고효、은정표체구유중요작용.위차,종합운용료다충분석연건,대7충대전작물적협록체단백편마기인진행분석.결과표명:협록체단백편마기인적총감기구성재7충작물중차이불대,도시A함량최고,이G,C적함량교저；단재밀마자제3위적감기구성상각유명현차별,3충쌍자협작물편애이C,T결미적밀마자,이화본과적4충작물칙편애이T,C결미적밀마자；RSCU(동의밀마자적상대사용도)치현시출화본과작물유26개밀마자구유편호성,이쌍자협작물유25개밀마자구유편호성,단이자지간유22개상동적편호성밀마자.기우RSCU치적취류결과현시,식물적밀마자편호성구유충족특정,표명기우협록체단백편마기인적밀마자사용특성적취류결과가이작위계통발육분석적중요보충.
