江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2009年
1期
28-30,31
,共4页
王转梅%陈崇顺%王轶%曹伟杰%邹爱兰%马文晔%张娟
王轉梅%陳崇順%王軼%曹偉傑%鄒愛蘭%馬文曄%張娟
왕전매%진숭순%왕질%조위걸%추애란%마문엽%장연
烟草%基因组%碱性β-1,3-葡聚糖酶基因%克隆%生物信息学
煙草%基因組%堿性β-1,3-葡聚糖酶基因%剋隆%生物信息學
연초%기인조%감성β-1,3-포취당매기인%극륭%생물신식학
烟草碱性β-1,3-葡聚糖酶具有较强的抗真菌病害等作用.本研究根据烟草Samsun与抗真菌作用有关的碱性β-1,3-葡聚糖酶基因序列设计引物,以烟草(Nicotiana tabacum)品种Xanthi NN基因组DNA为模板,进行PCR扩增,后将扩增产物与pUC57-T载体重组,再以该重组体转化大肠杆菌DH5α,在对阳性克隆进行鉴定后测序,并对其编码酶蛋白进行了一级、二级、三级结构及蛋白质同源性比较等生物信息学分析.研究结果表明,该基因全长1 868 bp,包含2个外显子和1个内含子;除终止密码子外,共编码359个氨基酸(GenBank 登录号:EU867448).该酶分子量为28.4 kDa,pI为9.72,是一个碱性蛋白;具有多个螺旋、转角、延伸链和无规卷曲等二级结构,其中α-螺旋占35.65 %,β-转角占5.57%,延伸链占19.22%,无规卷曲占39.55 %;三级结构同源建模预测显示,它与香蕉(Musa supientum)β-1,3-葡聚糖酶(PDB number 2cygA)具有60%的一致性;推测该酶蛋白与颠茄(Atropa belladonna)、马铃薯(Solanum tuberosum)等茄科植物的β-1,3-葡聚糖酶编码序列同源性分别达到89%和81%.本研究结果为进一步开展烟草抗真菌的β-1,3-葡聚糖酶的基因工程研究奠定了重要基础.
煙草堿性β-1,3-葡聚糖酶具有較彊的抗真菌病害等作用.本研究根據煙草Samsun與抗真菌作用有關的堿性β-1,3-葡聚糖酶基因序列設計引物,以煙草(Nicotiana tabacum)品種Xanthi NN基因組DNA為模闆,進行PCR擴增,後將擴增產物與pUC57-T載體重組,再以該重組體轉化大腸桿菌DH5α,在對暘性剋隆進行鑒定後測序,併對其編碼酶蛋白進行瞭一級、二級、三級結構及蛋白質同源性比較等生物信息學分析.研究結果錶明,該基因全長1 868 bp,包含2箇外顯子和1箇內含子;除終止密碼子外,共編碼359箇氨基痠(GenBank 登錄號:EU867448).該酶分子量為28.4 kDa,pI為9.72,是一箇堿性蛋白;具有多箇螺鏇、轉角、延伸鏈和無規捲麯等二級結構,其中α-螺鏇佔35.65 %,β-轉角佔5.57%,延伸鏈佔19.22%,無規捲麯佔39.55 %;三級結構同源建模預測顯示,它與香蕉(Musa supientum)β-1,3-葡聚糖酶(PDB number 2cygA)具有60%的一緻性;推測該酶蛋白與顛茄(Atropa belladonna)、馬鈴藷(Solanum tuberosum)等茄科植物的β-1,3-葡聚糖酶編碼序列同源性分彆達到89%和81%.本研究結果為進一步開展煙草抗真菌的β-1,3-葡聚糖酶的基因工程研究奠定瞭重要基礎.
연초감성β-1,3-포취당매구유교강적항진균병해등작용.본연구근거연초Samsun여항진균작용유관적감성β-1,3-포취당매기인서렬설계인물,이연초(Nicotiana tabacum)품충Xanthi NN기인조DNA위모판,진행PCR확증,후장확증산물여pUC57-T재체중조,재이해중조체전화대장간균DH5α,재대양성극륭진행감정후측서,병대기편마매단백진행료일급、이급、삼급결구급단백질동원성비교등생물신식학분석.연구결과표명,해기인전장1 868 bp,포함2개외현자화1개내함자;제종지밀마자외,공편마359개안기산(GenBank 등록호:EU867448).해매분자량위28.4 kDa,pI위9.72,시일개감성단백;구유다개라선、전각、연신련화무규권곡등이급결구,기중α-라선점35.65 %,β-전각점5.57%,연신련점19.22%,무규권곡점39.55 %;삼급결구동원건모예측현시,타여향초(Musa supientum)β-1,3-포취당매(PDB number 2cygA)구유60%적일치성;추측해매단백여전가(Atropa belladonna)、마령서(Solanum tuberosum)등가과식물적β-1,3-포취당매편마서렬동원성분별체도89%화81%.본연구결과위진일보개전연초항진균적β-1,3-포취당매적기인공정연구전정료중요기출.