人类免疫缺陷病毒1型AE重组亚型毒株全长gp120基因序列分析
인류면역결함병독1형AE중조아형독주전장gp120기인서렬분석
Sequence analysis of the full-length glycoprotein 120 gene of HIV-1 CRF01_AE in Fujian, China
  • 万方数据
    中华医学杂志 중화의학잡지
    National Medical Journal of China
    2006年 44期 3104-3108 ,共5页

    黄海龙%郑健%颜苹苹%吴守丽%陈舸%林勋%郑武雄%谢美榕%张建明%严延生

    황해룡%정건%안평평%오수려%진가%림훈%정무웅%사미용%장건명%엄연생

    HIV-1%序列分析%HIV包膜蛋白质GP120 HIV-1%序列分析%HIV包膜蛋白質GP120
    HIV-1%서렬분석%HIV포막단백질GP120
    目的 研究人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)AE重组型(CRF01_AE)毒株全长gp120基因的变异特征,为针对CRF01_AE重组型的免疫学研究和疫苗的研制提供帮助.方法 应用巢式PCR对福建省2004至2005年期间100例HIV-1CRF01_AE感染者随机抽取21份血样的外膜蛋白全长gp120进行扩增、回收、克隆至T载体后测序,应用MEGA、DNASIS、CLUSTAL1.83、N-GLYCOSITE等软件对HIV-1全长gp120序列进行分析.结果 基因系统树显示这21份样本属于CRF01_AE重组型HIV-1株,样本组内基因距离为9.5%±2.5%.V3环顶端四肽存在4种类型:GPGQ(71.43%),GPGR(19.05%),GPGH(4.76%),GQGQ(4.76%).根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况的结果显示,16份(76.19%)可能使用CCR5作为辅助受体,1份(4.76%)样本可能使用CCRS/CXCR4序列,4份样本(19.05%)不能做出预测.21条HIV-1全长gp120氨基酸序列中,C1-C5比较保守,而V1-V5变化较大,其中V3相对保守.N糖基化位点分析发现大多数位点较为保守,少数发生糖基化位点丢失和增加.结论 福建省大部分CRF01_AE重组型毒株与东南亚代表株关系密切,来源较为复杂,大部分CRF01_AE重组毒株为NSI型,gp120基因变异大,该研究为以后的病毒免疫学和疫苗的研究提供丰富的材料和基础数据.
    목적 연구인류면역결함병독1형(HIV-1)AE중조형(CRF01_AE)독주전장gp120기인적변이특정,위침대CRF01_AE중조형적면역학연구화역묘적연제제공방조.방법 응용소식PCR대복건성2004지2005년기간100례HIV-1CRF01_AE감염자수궤추취21빈혈양적외막단백전장gp120진행확증、회수、극륭지T재체후측서,응용MEGA、DNASIS、CLUSTAL1.83、N-GLYCOSITE등연건대HIV-1전장gp120서렬진행분석.결과 기인계통수현시저21빈양본속우CRF01_AE중조형HIV-1주,양본조내기인거리위9.5%±2.5%.V3배정단사태존재4충류형:GPGQ(71.43%),GPGR(19.05%),GPGH(4.76%),GQGQ(4.76%).근거V3배관건안기산추측보조수체사용정황적결과현시,16빈(76.19%)가능사용CCR5작위보조수체,1빈(4.76%)양본가능사용CCRS/CXCR4서렬,4빈양본(19.05%)불능주출예측.21조HIV-1전장gp120안기산서렬중,C1-C5비교보수,이V1-V5변화교대,기중V3상대보수.N당기화위점분석발현대다수위점교위보수,소수발생당기화위점주실화증가.결론 복건성대부분CRF01_AE중조형독주여동남아대표주관계밀절,래원교위복잡,대부분CRF01_AE중조독주위NSI형,gp120기인변이대,해연구위이후적병독면역학화역묘적연구제공봉부적재료화기출수거.
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