应用生物信息学方法筛选幽门螺杆菌疫苗候选抗原
응용생물신식학방법사선유문라간균역묘후선항원
Screening Vaccine Candidate Antigens from Helicobacter pylori by Bioinformatics Methods
  • 万方数据
    生物技术通讯 생물기술통신
    LETTERS IN BIOTECHNOLOGY
    2009年 2期 195-198 ,共4页

    王涛%陶好霞%王令春%袁盛凌%展德文%王芃%王艳春%张微%姜娜%张兆山%刘纯杰

    왕도%도호하%왕령춘%원성릉%전덕문%왕봉%왕염춘%장미%강나%장조산%류순걸

    幽门螺杆菌%疫苗%抗原%筛选%生物信息学 幽門螺桿菌%疫苗%抗原%篩選%生物信息學
    유문라간균%역묘%항원%사선%생물신식학
    目的:应用生物信息学分析方法筛选幽门螺杆菌新的疫苗候选抗原.方法:从TIGR CMR下载幽门螺杆菌26695和J99株全基因组序列,应用生物信息学SignalP、PredTMBB、LipoP、TMHMM、Phobius、PSORT-B和SubLoc等分析软件,筛选幽门螺杆菌新的外膜蛋白和分泌蛋白疫苗候选抗原.结果:从幽门螺杆菌26695株筛选得到54个编码β-桶型跨膜蛋白、脂蛋白或分泌表达蛋白的疫苗候选蛋白抗原,从幽门螺杆菌J99株得到61个呈现上述表达方式的疫苗候选蛋白抗原;且这2株细菌的疫苗候选蛋白呈现良好的交集状况,即有43个候选疫苗蛋白是相同的.结论:用生物信息学分析方法可以从全基因组范围内快速筛选到保守的分泌或表面暴露的疫苗候选抗原,为疫苗抗原的快速筛选与鉴定奠定了基础.
    목적:응용생물신식학분석방법사선유문라간균신적역묘후선항원.방법:종TIGR CMR하재유문라간균26695화J99주전기인조서렬,응용생물신식학SignalP、PredTMBB、LipoP、TMHMM、Phobius、PSORT-B화SubLoc등분석연건,사선유문라간균신적외막단백화분비단백역묘후선항원.결과:종유문라간균26695주사선득도54개편마β-통형과막단백、지단백혹분비표체단백적역묘후선단백항원,종유문라간균J99주득도61개정현상술표체방식적역묘후선단백항원;차저2주세균적역묘후선단백정현량호적교집상황,즉유43개후선역묘단백시상동적.결론:용생물신식학분석방법가이종전기인조범위내쾌속사선도보수적분비혹표면폭로적역묘후선항원,위역묘항원적쾌속사선여감정전정료기출.
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