四川农业大学学报
四川農業大學學報
사천농업대학학보
JOURNAL OF SICHUAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2011年
3期
299-303
,共5页
赵海霞%白悦辰%陈惠%吴琦
趙海霞%白悅辰%陳惠%吳琦
조해하%백열신%진혜%오기
金荞麦%ITS%PCR%序列分析
金蕎麥%ITS%PCR%序列分析
금교맥%ITS%PCR%서렬분석
以5份金荞麦为材料,对其核糖体基因内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增,均获得长约700 bp左右的特异性产物.测序结果表明,金荞麦样品中ITS序列在638～797 bp之间.经软件Clustal X2.0和MEGA 4.0分析结果表明,当空位作为缺失处理时,ITS区全序列包括488个保守位点,248个变异位点,67个简约信息位点,175个单个碱基变化位点.通过与GenBank已登录的金荞麦的ITS进行序列比对后发现,其同源度在86.8％～98.8％,其变异位点主要存在于ITS1,表现出丰富的遗传多样性.采用邻接法构建的系统进化树表明,金荞麦主要分为两大类群,其遗传距离与其采集地有一定相关性.
以5份金蕎麥為材料,對其覈糖體基因內轉錄間隔區(ITS)序列進行PCR擴增,均穫得長約700 bp左右的特異性產物.測序結果錶明,金蕎麥樣品中ITS序列在638～797 bp之間.經軟件Clustal X2.0和MEGA 4.0分析結果錶明,噹空位作為缺失處理時,ITS區全序列包括488箇保守位點,248箇變異位點,67箇簡約信息位點,175箇單箇堿基變化位點.通過與GenBank已登錄的金蕎麥的ITS進行序列比對後髮現,其同源度在86.8％～98.8％,其變異位點主要存在于ITS1,錶現齣豐富的遺傳多樣性.採用鄰接法構建的繫統進化樹錶明,金蕎麥主要分為兩大類群,其遺傳距離與其採集地有一定相關性.
이5빈금교맥위재료,대기핵당체기인내전록간격구(ITS)서렬진행PCR확증,균획득장약700 bp좌우적특이성산물.측서결과표명,금교맥양품중ITS서렬재638～797 bp지간.경연건Clustal X2.0화MEGA 4.0분석결과표명,당공위작위결실처리시,ITS구전서렬포괄488개보수위점,248개변이위점,67개간약신식위점,175개단개감기변화위점.통과여GenBank이등록적금교맥적ITS진행서렬비대후발현,기동원도재86.8％～98.8％,기변이위점주요존재우ITS1,표현출봉부적유전다양성.채용린접법구건적계통진화수표명,금교맥주요분위량대류군,기유전거리여기채집지유일정상관성.
