激光生物学报
激光生物學報
격광생물학보
ACTA LASER BIOLOGY SINICA
2009年
1期
121-127
,共7页
姜彬%王正华%王勇献%贺细平
薑彬%王正華%王勇獻%賀細平
강빈%왕정화%왕용헌%하세평
膜蛋白%k子串%离散源%离散增量%K近邻
膜蛋白%k子串%離散源%離散增量%K近鄰
막단백%k자천%리산원%리산증량%K근린
膜蛋白是生物膜功能的主要体现者,是细胞执行各种功能的物质基础,在细胞中发挥着至关重要的作用.分类预测未知类型的膜蛋白对于生物学相关研究具有指导性意义,是膜蛋白结构与功能研究领域的一项重要基础性工作.针对膜蛋白分类预测问题,利用k子串离散源的方法对膜蛋白序列进行特征提取,并融合最小离散增量方法和加权K近邻算法构建一种新型的膜蛋白分类预测模型,在自检验、Jackknife检验和独立测试集检验三种典型的检验方式下,预测准确率分别为99.95%、86.16%和98.36%.实验结果表明,k子串离散源方法能够有效提取膜蛋白序列的特征信息,与现有方法相比,该分类模型具有较高的分类预测成功率.
膜蛋白是生物膜功能的主要體現者,是細胞執行各種功能的物質基礎,在細胞中髮揮著至關重要的作用.分類預測未知類型的膜蛋白對于生物學相關研究具有指導性意義,是膜蛋白結構與功能研究領域的一項重要基礎性工作.針對膜蛋白分類預測問題,利用k子串離散源的方法對膜蛋白序列進行特徵提取,併融閤最小離散增量方法和加權K近鄰算法構建一種新型的膜蛋白分類預測模型,在自檢驗、Jackknife檢驗和獨立測試集檢驗三種典型的檢驗方式下,預測準確率分彆為99.95%、86.16%和98.36%.實驗結果錶明,k子串離散源方法能夠有效提取膜蛋白序列的特徵信息,與現有方法相比,該分類模型具有較高的分類預測成功率.
막단백시생물막공능적주요체현자,시세포집행각충공능적물질기출,재세포중발휘착지관중요적작용.분류예측미지류형적막단백대우생물학상관연구구유지도성의의,시막단백결구여공능연구영역적일항중요기출성공작.침대막단백분류예측문제,이용k자천리산원적방법대막단백서렬진행특정제취,병융합최소리산증량방법화가권K근린산법구건일충신형적막단백분류예측모형,재자검험、Jackknife검험화독립측시집검험삼충전형적검험방식하,예측준학솔분별위99.95%、86.16%화98.36%.실험결과표명,k자천리산원방법능구유효제취막단백서렬적특정신식,여현유방법상비,해분류모형구유교고적분류예측성공솔.