遗传学报
遺傳學報
유전학보
ACTA GENETICA SINICA
2005年
7期
726-732
,共7页
水稻%14-3-3蛋白%基因家族%进化分析%基因结构
水稻%14-3-3蛋白%基因傢族%進化分析%基因結構
수도%14-3-3단백%기인가족%진화분석%기인결구
通过隐马尔柯夫模型(Hidden Markov Model,HMM),对粳稻(Oryza sativa L.ssp.japonica)基因组的蛋白质数据库进行搜索,结果获得8个14-3-3蛋白的同源序列,其中发现4个新基因.通过对所有粳稻的14-3-3蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(Expression Sequence Tags,ESTs)进一步比对,为14-3-3蛋白找到了ESTs的证据.结果说明这些基因在水稻不同的处理和不同的部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异.蛋白质多序列联配分析结果表明,存在可能的功能多态位点.通过基因结构和染色体定位的分析,确认了水稻基因组中存在ε样和非ε样两类14-3-3蛋白.此外,对目前植物中的14-3-3家族作了初步的进化分析.
通過隱馬爾柯伕模型(Hidden Markov Model,HMM),對粳稻(Oryza sativa L.ssp.japonica)基因組的蛋白質數據庫進行搜索,結果穫得8箇14-3-3蛋白的同源序列,其中髮現4箇新基因.通過對所有粳稻的14-3-3蛋白的DNA序列與各種錶達序列標籤(Expression Sequence Tags,ESTs)進一步比對,為14-3-3蛋白找到瞭ESTs的證據.結果說明這些基因在水稻不同的處理和不同的部位都有所錶達,而且不同成員之間的錶達模式存在較大的差異.蛋白質多序列聯配分析結果錶明,存在可能的功能多態位點.通過基因結構和染色體定位的分析,確認瞭水稻基因組中存在ε樣和非ε樣兩類14-3-3蛋白.此外,對目前植物中的14-3-3傢族作瞭初步的進化分析.
통과은마이가부모형(Hidden Markov Model,HMM),대갱도(Oryza sativa L.ssp.japonica)기인조적단백질수거고진행수색,결과획득8개14-3-3단백적동원서렬,기중발현4개신기인.통과대소유갱도적14-3-3단백적DNA서렬여각충표체서렬표첨(Expression Sequence Tags,ESTs)진일보비대,위14-3-3단백조도료ESTs적증거.결과설명저사기인재수도불동적처리화불동적부위도유소표체,이차불동성원지간적표체모식존재교대적차이.단백질다서렬련배분석결과표명,존재가능적공능다태위점.통과기인결구화염색체정위적분석,학인료수도기인조중존재ε양화비ε양량류14-3-3단백.차외,대목전식물중적14-3-3가족작료초보적진화분석.
