江西农业学报
江西農業學報
강서농업학보
ACTA AGRICULTURAE JIANGXI
2011年
12期
23-27
,共5页
刘更森%慕茜%戴洪义%上官凌飞%张玉刚
劉更森%慕茜%戴洪義%上官凌飛%張玉剛
류경삼%모천%대홍의%상관릉비%장옥강
苹果%SBP基因家族%氨基酸序列%生物信息学
蘋果%SBP基因傢族%氨基痠序列%生物信息學
평과%SBP기인가족%안기산서렬%생물신식학
首先利用生物信息学方法对苹果42条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥的SBP基因家族之间的联系.结果显示着42条蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起被分成了7个亚族,拟南芥与苹果SBP基因间具有较高的保守性.基因组定位结果显示42条SBP基因分布在12条染色体上.研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列疏水性存在一定的差异;二级结构预测分析发现,42条氨基酸序列以随机卷曲和α-螺旋为主要组成部分,而且42条氨基酸序列三维结构相似.
首先利用生物信息學方法對蘋果42條SBP蛋白序列的繫統髮生和SBP基因組定位進行分析,然後對其氨基痠組成成分、理化性質以及二級和三級結構進行預測和分析,同時還分析瞭蘋果與擬南芥的SBP基因傢族之間的聯繫.結果顯示著42條蛋白序列與擬南芥16條SBP蛋白序列一起被分成瞭7箇亞族,擬南芥與蘋果SBP基因間具有較高的保守性.基因組定位結果顯示42條SBP基因分佈在12條染色體上.研究還髮現不同亞族間氨基痠數目、氨基痠序列疏水性存在一定的差異;二級結構預測分析髮現,42條氨基痠序列以隨機捲麯和α-螺鏇為主要組成部分,而且42條氨基痠序列三維結構相似.
수선이용생물신식학방법대평과42조SBP단백서렬적계통발생화SBP기인조정위진행분석,연후대기안기산조성성분、이화성질이급이급화삼급결구진행예측화분석,동시환분석료평과여의남개적SBP기인가족지간적련계.결과현시착42조단백서렬여의남개16조SBP단백서렬일기피분성료7개아족,의남개여평과SBP기인간구유교고적보수성.기인조정위결과현시42조SBP기인분포재12조염색체상.연구환발현불동아족간안기산수목、안기산서렬소수성존재일정적차이;이급결구예측분석발현,42조안기산서렬이수궤권곡화α-라선위주요조성부분,이차42조안기산서렬삼유결구상사.