浙江海洋学院学报(自然科学版)
浙江海洋學院學報(自然科學版)
절강해양학원학보(자연과학판)
JOURNAL OF ZHEJIANG OCEAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2011年
2期
99-106
,共8页
王丹生%程远志%徐田军%王日昕
王丹生%程遠誌%徐田軍%王日昕
왕단생%정원지%서전군%왕일흔
Cytb%鲱形目%系统发育%锯腹鳓科%宝刀鱼科
Cytb%鯡形目%繫統髮育%鋸腹鰳科%寶刀魚科
Cytb%비형목%계통발육%거복륵과%보도어과
鲱形目内科间分类关系一直以来存在较多争议,为探讨鲱形目系统发育关系,对黄鲫、凤鲚的线粒体Cyt b基因全序列进行扩增、克隆及测序,得到1 141 bp序列.结合Genbank中已发布的鲱形目鱼类Cyt b基因全长序列利用生物信息学软件进行比较分析后,共检测到553个变异位点,总变异为48.5%,其中含504个简约信息位点,未见序列插入或缺失.碱基的替换多在密码子第三位,序列中转换多于颠换,Ts/Tv为2.448,基因突变未达到饱和.基于K2P模型计算的遗传距离表明,宝刀鱼科同鲱科及鳀科的科间遗传距离(0.042~0.072)小于鲱科内属间遗传距离(0.065~0.106).在以南美肺鱼为外群构建的NJ分子系统树中,齿头鲱科最先分化,是鲱形目中原始类群;鳓属、多齿鳓属独立聚为一支,且具较高的自举检验值,支持将其归入锯腹鳓科;宝刀鱼科并入到鲱科一支中去,与鲱科亲缘关系更近.
鯡形目內科間分類關繫一直以來存在較多爭議,為探討鯡形目繫統髮育關繫,對黃鯽、鳳鱭的線粒體Cyt b基因全序列進行擴增、剋隆及測序,得到1 141 bp序列.結閤Genbank中已髮佈的鯡形目魚類Cyt b基因全長序列利用生物信息學軟件進行比較分析後,共檢測到553箇變異位點,總變異為48.5%,其中含504箇簡約信息位點,未見序列插入或缺失.堿基的替換多在密碼子第三位,序列中轉換多于顛換,Ts/Tv為2.448,基因突變未達到飽和.基于K2P模型計算的遺傳距離錶明,寶刀魚科同鯡科及鳀科的科間遺傳距離(0.042~0.072)小于鯡科內屬間遺傳距離(0.065~0.106).在以南美肺魚為外群構建的NJ分子繫統樹中,齒頭鯡科最先分化,是鯡形目中原始類群;鰳屬、多齒鰳屬獨立聚為一支,且具較高的自舉檢驗值,支持將其歸入鋸腹鰳科;寶刀魚科併入到鯡科一支中去,與鯡科親緣關繫更近.
비형목내과간분류관계일직이래존재교다쟁의,위탐토비형목계통발육관계,대황즉、봉제적선립체Cyt b기인전서렬진행확증、극륭급측서,득도1 141 bp서렬.결합Genbank중이발포적비형목어류Cyt b기인전장서렬이용생물신식학연건진행비교분석후,공검측도553개변이위점,총변이위48.5%,기중함504개간약신식위점,미견서렬삽입혹결실.감기적체환다재밀마자제삼위,서렬중전환다우전환,Ts/Tv위2.448,기인돌변미체도포화.기우K2P모형계산적유전거리표명,보도어과동비과급제과적과간유전거리(0.042~0.072)소우비과내속간유전거리(0.065~0.106).재이남미폐어위외군구건적NJ분자계통수중,치두비과최선분화,시비형목중원시류군;륵속、다치륵속독립취위일지,차구교고적자거검험치,지지장기귀입거복륵과;보도어과병입도비과일지중거,여비과친연관계경근.