内蒙古大学学报(自然科学版)
內矇古大學學報(自然科學版)
내몽고대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF INNER MONGOLIA AGRICULTURAL UNIVERSITY
2009年
2期
178-185
,共8页
蛋白质超家族%模式%模体的功能%模体相对位置分布
蛋白質超傢族%模式%模體的功能%模體相對位置分佈
단백질초가족%모식%모체적공능%모체상대위치분포
选取了全α类中序列一致性小于等于40%和25%的四个有代表性的超家族,并从中提取序列模体和结构模体,分析了其结构和功能特征的差异. 结果表明,细胞色素C超家族和EF手超家族中已知功能的模体类型相对单一,而类同源域超家族和翼螺旋DNA结合域超家族中序列模体类型较多,但是主要以HTH和wHTH两种结构模体为主. 进一步对模体的相对位置进行统计分析和比较,发现无论是已知功能的模体还是基于统计学方法识别的模体,它们相对于序列N端和C端的分布均呈现一定的规律性. 这些特征和规律将对蛋白质超家族的识别以及结构域的研究提供有力的帮助.
選取瞭全α類中序列一緻性小于等于40%和25%的四箇有代錶性的超傢族,併從中提取序列模體和結構模體,分析瞭其結構和功能特徵的差異. 結果錶明,細胞色素C超傢族和EF手超傢族中已知功能的模體類型相對單一,而類同源域超傢族和翼螺鏇DNA結閤域超傢族中序列模體類型較多,但是主要以HTH和wHTH兩種結構模體為主. 進一步對模體的相對位置進行統計分析和比較,髮現無論是已知功能的模體還是基于統計學方法識彆的模體,它們相對于序列N耑和C耑的分佈均呈現一定的規律性. 這些特徵和規律將對蛋白質超傢族的識彆以及結構域的研究提供有力的幫助.
선취료전α류중서렬일치성소우등우40%화25%적사개유대표성적초가족,병종중제취서렬모체화결구모체,분석료기결구화공능특정적차이. 결과표명,세포색소C초가족화EF수초가족중이지공능적모체류형상대단일,이류동원역초가족화익라선DNA결합역초가족중서렬모체류형교다,단시주요이HTH화wHTH량충결구모체위주. 진일보대모체적상대위치진행통계분석화비교,발현무론시이지공능적모체환시기우통계학방법식별적모체,타문상대우서렬N단화C단적분포균정현일정적규률성. 저사특정화규률장대단백질초가족적식별이급결구역적연구제공유력적방조.
