生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2008年
1期
77-84
,共8页
贺治国%钟慧%李庆华%顾帼华%胡岳华%李桂源
賀治國%鐘慧%李慶華%顧幗華%鬍嶽華%李桂源
하치국%종혜%리경화%고귁화%호악화%리계원
氧化亚铁硫杆菌%磷酸盐缺失%蛋白质组学%生物浸出%SELDI蛋白质芯片技术
氧化亞鐵硫桿菌%燐痠鹽缺失%蛋白質組學%生物浸齣%SELDI蛋白質芯片技術
양화아철류간균%린산염결실%단백질조학%생물침출%SELDI단백질심편기술
A cidithiobacillus ferrooxidans%phosphate starvation%proteomics%SELDI Protein Chip
氧化亚铁硫杆菌(At.f)是能够利用Fe2+和硫化矿来获取能量的一种化能自养菌.这种细菌在金属硫化矿的生物浸出中起着重要的作用.在硫化矿的生物浸出过程中,浸矿细菌通常会遇到多种胁迫条件,如温度的变化、营养成分的缺失和pH值的变化等,这些因素会影响到细菌的活性.因此对在胁迫条件下这类细菌的应急反应生理机制的研究具有重要的意义.SELDI蛋白质芯片技术是近年一种高通量的蛋白质组学研究技术.测定了以Fe2+为能源正常条件培养的At.f和磷酸盐缺失培养At.f的生长情况,绘制了相应的生长曲线;采用NP20蛋白质芯片,对At.f总蛋白的蛋白质芯片上样量进行了优化.在此基础上,采用IMAC-Cu、SAX2、WCX2三种特异性SELDI蛋白质芯片技术,获取了磷酸盐缺失培养At.f与正常条件培养的At.f的比较蛋白质图谱,采用软件对比较蛋白质图谱进行分析,发现了磷酸盐缺失培养At.f的13个明显差异表达的蛋白质分子,为进一步分离鉴定这些差异表达蛋白质奠定了基础.
氧化亞鐵硫桿菌(At.f)是能夠利用Fe2+和硫化礦來穫取能量的一種化能自養菌.這種細菌在金屬硫化礦的生物浸齣中起著重要的作用.在硫化礦的生物浸齣過程中,浸礦細菌通常會遇到多種脅迫條件,如溫度的變化、營養成分的缺失和pH值的變化等,這些因素會影響到細菌的活性.因此對在脅迫條件下這類細菌的應急反應生理機製的研究具有重要的意義.SELDI蛋白質芯片技術是近年一種高通量的蛋白質組學研究技術.測定瞭以Fe2+為能源正常條件培養的At.f和燐痠鹽缺失培養At.f的生長情況,繪製瞭相應的生長麯線;採用NP20蛋白質芯片,對At.f總蛋白的蛋白質芯片上樣量進行瞭優化.在此基礎上,採用IMAC-Cu、SAX2、WCX2三種特異性SELDI蛋白質芯片技術,穫取瞭燐痠鹽缺失培養At.f與正常條件培養的At.f的比較蛋白質圖譜,採用軟件對比較蛋白質圖譜進行分析,髮現瞭燐痠鹽缺失培養At.f的13箇明顯差異錶達的蛋白質分子,為進一步分離鑒定這些差異錶達蛋白質奠定瞭基礎.
양화아철류간균(At.f)시능구이용Fe2+화류화광래획취능량적일충화능자양균.저충세균재금속류화광적생물침출중기착중요적작용.재류화광적생물침출과정중,침광세균통상회우도다충협박조건,여온도적변화、영양성분적결실화pH치적변화등,저사인소회영향도세균적활성.인차대재협박조건하저류세균적응급반응생리궤제적연구구유중요적의의.SELDI단백질심편기술시근년일충고통량적단백질조학연구기술.측정료이Fe2+위능원정상조건배양적At.f화린산염결실배양At.f적생장정황,회제료상응적생장곡선;채용NP20단백질심편,대At.f총단백적단백질심편상양량진행료우화.재차기출상,채용IMAC-Cu、SAX2、WCX2삼충특이성SELDI단백질심편기술,획취료린산염결실배양At.f여정상조건배양적At.f적비교단백질도보,채용연건대비교단백질도보진행분석,발현료린산염결실배양At.f적13개명현차이표체적단백질분자,위진일보분리감정저사차이표체단백질전정료기출.
A cidithiobacillus ferrooxidans is a chemolithotrophic microorganism capable of using ferrous ions and sulphides as energy sources. This microorganism has an important role in the bioleaching of minerals. During this process, the bacteria are normally subjected to several stressing conditions, such as temperature changes, lack of nutrients or pH changes, which may affect the efficiency of the bacterial action. SELDI is a recent technology that allows for high-throughput proteomics studies. The Protein Chip SELDI technology was used to generate comparative protein profiles of A c idithiobacillus ferrooxidans grown under phosphate starvation or normal condition additionally adding Fe2+ as energy resource. There were 13 significantly differential expressed protein's peaks found by using SELDI Protein Chip technologies, which made a solid foundation for further isolation these low molecular proteins by adopting technologies such as HPLC etc.