中国生物医学工程学报
中國生物醫學工程學報
중국생물의학공정학보
CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING
2008年
4期
537-542
,共6页
匡斌%饶妮妮%韩凤君%徐尚蕾
劻斌%饒妮妮%韓鳳君%徐尚蕾
광빈%요니니%한봉군%서상뢰
吉布斯采样%模体%位置权重矩阵%模体寻找
吉佈斯採樣%模體%位置權重矩陣%模體尋找
길포사채양%모체%위치권중구진%모체심조
当前有许多用于预测模体的算法,但没有一种算法能有效地应用在所有场合.依据位置权重矩阵的模体模型,提出一种改进的吉布斯采样算法来识别模体.该算法有效地克服了吉布斯采样算法的局部收敛性,并且可以直观地控制预测模体的保守度.同时引入了模体库的概念,并通过分析模体库数据,提高了模体预测的灵活性和准确率.设计了仿真数据,并选择了已被生物实验验证过的模体数据,证实本算法的可行性和有效性.与当前常用的基于吉布斯采样改进的算法比较,本算法有效地提高了模体预测的准确性、灵活性和稳定性.
噹前有許多用于預測模體的算法,但沒有一種算法能有效地應用在所有場閤.依據位置權重矩陣的模體模型,提齣一種改進的吉佈斯採樣算法來識彆模體.該算法有效地剋服瞭吉佈斯採樣算法的跼部收斂性,併且可以直觀地控製預測模體的保守度.同時引入瞭模體庫的概唸,併通過分析模體庫數據,提高瞭模體預測的靈活性和準確率.設計瞭倣真數據,併選擇瞭已被生物實驗驗證過的模體數據,證實本算法的可行性和有效性.與噹前常用的基于吉佈斯採樣改進的算法比較,本算法有效地提高瞭模體預測的準確性、靈活性和穩定性.
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