分析测试学报
分析測試學報
분석측시학보
JOURNAL OF INSTRUMENTAL ANALYSIS
2010年
5期
421-429
,共9页
张一甫%秦兆宇%刘晓慧%林成招%贺福初
張一甫%秦兆宇%劉曉慧%林成招%賀福初
장일보%진조우%류효혜%림성초%하복초
iTRAQ%2D LC-MS/MS%肝脏再生%差异蛋白质组
iTRAQ%2D LC-MS/MS%肝髒再生%差異蛋白質組
iTRAQ%2D LC-MS/MS%간장재생%차이단백질조
首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝脏蛋白质的表达差异.共鉴定357种蛋白质,6个时间点共有60种蛋白质的表达量与对照组(手术切下的正常肝组织)有显著差异.其中,ADH1(Alcohol dehydrogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的表达变化趋势与已有报道相同,GO(Gene ontology)的蛋白质功能注释提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A- Ⅰ)等可能通过影响细胞凋亡和能量供给等方式参与肝再生调控.聚类分析表明,术后12 h和24 h蛋白质的整体表达模式相似,6 h与此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h与这些时间点相差最远.该研究验证了8标iTRAQ是并行处理多组样本的有效技术,适合于生理和病理过程多时间点蛋白质组的定量差异分析,可以监控关键分子的动态变化,更易发掘重要的调控靶点分子.该文为进一步探讨肝再生机理提供了有价值的线索.
首次應用8標iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術結閤2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠為模型,全麵分析瞭再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝髒蛋白質的錶達差異.共鑒定357種蛋白質,6箇時間點共有60種蛋白質的錶達量與對照組(手術切下的正常肝組織)有顯著差異.其中,ADH1(Alcohol dehydrogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的錶達變化趨勢與已有報道相同,GO(Gene ontology)的蛋白質功能註釋提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A- Ⅰ)等可能通過影響細胞凋亡和能量供給等方式參與肝再生調控.聚類分析錶明,術後12 h和24 h蛋白質的整體錶達模式相似,6 h與此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h與這些時間點相差最遠.該研究驗證瞭8標iTRAQ是併行處理多組樣本的有效技術,適閤于生理和病理過程多時間點蛋白質組的定量差異分析,可以鑑控關鍵分子的動態變化,更易髮掘重要的調控靶點分子.該文為進一步探討肝再生機理提供瞭有價值的線索.
수차응용8표iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)기술결합2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),이부분간절제적대서위모형,전면분석료재생조기(6、12 h)、중기(24、48 h)화만기(72、120 h)간장단백질적표체차이.공감정357충단백질,6개시간점공유60충단백질적표체량여대조조(수술절하적정상간조직)유현저차이.기중,ADH1(Alcohol dehydrogenase 1)화PRDX1(Peroxiredoxin 1)등적표체변화추세여이유보도상동,GO(Gene ontology)적단백질공능주석제시ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)화APOA1(Apolipoprotein A- Ⅰ)등가능통과영향세포조망화능량공급등방식삼여간재생조공.취류분석표명,술후12 h화24 h단백질적정체표체모식상사,6 h여차이자상근,48 h화72 h상사,이120 h여저사시간점상차최원.해연구험증료8표iTRAQ시병행처리다조양본적유효기술,괄합우생리화병리과정다시간점단백질조적정량차이분석,가이감공관건분자적동태변화,경역발굴중요적조공파점분자.해문위진일보탐토간재생궤리제공료유개치적선색.