作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2011年
10期
1724-1734
,共11页
张乐%李英慧%刘章雄%邱丽娟
張樂%李英慧%劉章雄%邱麗娟
장악%리영혜%류장웅%구려연
大豆%Glyma13g21630%单核苷酸多态性%单倍型
大豆%Glyma13g21630%單覈苷痠多態性%單倍型
대두%Glyma13g21630%단핵감산다태성%단배형
利用Sanger方法对49份野生大豆,46份地方品种和38份选育品种的Glyma13g21630进行基因测序,采用DNAStar、Mega、DNAsp和Tassel软件分析Glyma13g21630的单核苷酸多态性(SNP)位点在3种类型大豆群体的分布规律.结果表明,在133份供试种质中检测到29个多态性位点,包括22个SNP和7个InDel,多态性频率分别为1SNP/138 bp和1InDel/434 bp.Glyma13g21630基因序列中多态性位点的分布不均匀,其中内含子3和5为变异富集区,其他区域变异较小.单倍型分析表明,Glyma13g21630在野生大豆和栽培大豆中的多态性位点数目逐渐减少,分布范围也越来越窄；连锁不平衡分析表明,野生大豆的7个高频SNP位点中有42.86％处于极显著的连锁不平衡状态；Ka/Ks＞1,说明野生大豆在向栽培大豆的进化中,某些位点受到正向选择,多态性显著降低.Glyma13g21630基因在大豆由野生向栽培驯化的过程中因正向选择作用而固定了有益变异,表现出瓶颈效应.
利用Sanger方法對49份野生大豆,46份地方品種和38份選育品種的Glyma13g21630進行基因測序,採用DNAStar、Mega、DNAsp和Tassel軟件分析Glyma13g21630的單覈苷痠多態性(SNP)位點在3種類型大豆群體的分佈規律.結果錶明,在133份供試種質中檢測到29箇多態性位點,包括22箇SNP和7箇InDel,多態性頻率分彆為1SNP/138 bp和1InDel/434 bp.Glyma13g21630基因序列中多態性位點的分佈不均勻,其中內含子3和5為變異富集區,其他區域變異較小.單倍型分析錶明,Glyma13g21630在野生大豆和栽培大豆中的多態性位點數目逐漸減少,分佈範圍也越來越窄；連鎖不平衡分析錶明,野生大豆的7箇高頻SNP位點中有42.86％處于極顯著的連鎖不平衡狀態；Ka/Ks＞1,說明野生大豆在嚮栽培大豆的進化中,某些位點受到正嚮選擇,多態性顯著降低.Glyma13g21630基因在大豆由野生嚮栽培馴化的過程中因正嚮選擇作用而固定瞭有益變異,錶現齣瓶頸效應.
이용Sanger방법대49빈야생대두,46빈지방품충화38빈선육품충적Glyma13g21630진행기인측서,채용DNAStar、Mega、DNAsp화Tassel연건분석Glyma13g21630적단핵감산다태성(SNP)위점재3충류형대두군체적분포규률.결과표명,재133빈공시충질중검측도29개다태성위점,포괄22개SNP화7개InDel,다태성빈솔분별위1SNP/138 bp화1InDel/434 bp.Glyma13g21630기인서렬중다태성위점적분포불균균,기중내함자3화5위변이부집구,기타구역변이교소.단배형분석표명,Glyma13g21630재야생대두화재배대두중적다태성위점수목축점감소,분포범위야월래월착；련쇄불평형분석표명,야생대두적7개고빈SNP위점중유42.86％처우겁현저적련쇄불평형상태；Ka/Ks＞1,설명야생대두재향재배대두적진화중,모사위점수도정향선택,다태성현저강저.Glyma13g21630기인재대두유야생향재배순화적과정중인정향선택작용이고정료유익변이,표현출병경효응.
