工程数学学报
工程數學學報
공정수학학보
CHINESE JOURNAL OF ENGINEERING MATHEMATICS
2006年
4期
632-640
,共9页
沈世镒%胡刚%王奎%董骝焕
瀋世鎰%鬍剛%王奎%董騮煥
침세일%호강%왕규%동류환
多重序列突变网络系统%突变网络的正交化理论%SARS序列分析
多重序列突變網絡繫統%突變網絡的正交化理論%SARS序列分析
다중서렬돌변망락계통%돌변망락적정교화이론%SARS서렬분석
为分析多重生物序列的突变结构,首先是要作它们的多重比对,在多重比对基础上可作出各序列的系统树与最小距离树,在最小距离树中如果把它们的弧用突变模结构来表示,那么我们称由此所产生的数学模型为多重序列突变网络系统(以下简称突变网络),突变网络分析的主要问题是如何确定各种不同类型突变的相互关系问题,一种最简单关系是二个突变的突变区域互不重叠,我们称之为正交化.因此突变网络分析的一个重要目的是对突变网络作正交化的简化,本文给出了突变网络正交化的基本定理,并以SARS病毒基因组为例,说明它们的突变网络系统模型与正交化运算,并由此得到SARS病毒从早期传播到爆发的基因突变过程的确定.
為分析多重生物序列的突變結構,首先是要作它們的多重比對,在多重比對基礎上可作齣各序列的繫統樹與最小距離樹,在最小距離樹中如果把它們的弧用突變模結構來錶示,那麽我們稱由此所產生的數學模型為多重序列突變網絡繫統(以下簡稱突變網絡),突變網絡分析的主要問題是如何確定各種不同類型突變的相互關繫問題,一種最簡單關繫是二箇突變的突變區域互不重疊,我們稱之為正交化.因此突變網絡分析的一箇重要目的是對突變網絡作正交化的簡化,本文給齣瞭突變網絡正交化的基本定理,併以SARS病毒基因組為例,說明它們的突變網絡繫統模型與正交化運算,併由此得到SARS病毒從早期傳播到爆髮的基因突變過程的確定.
위분석다중생물서렬적돌변결구,수선시요작타문적다중비대,재다중비대기출상가작출각서렬적계통수여최소거리수,재최소거리수중여과파타문적호용돌변모결구래표시,나요아문칭유차소산생적수학모형위다중서렬돌변망락계통(이하간칭돌변망락),돌변망락분석적주요문제시여하학정각충불동류형돌변적상호관계문제,일충최간단관계시이개돌변적돌변구역호불중첩,아문칭지위정교화.인차돌변망락분석적일개중요목적시대돌변망락작정교화적간화,본문급출료돌변망락정교화적기본정리,병이SARS병독기인조위례,설명타문적돌변망락계통모형여정교화운산,병유차득도SARS병독종조기전파도폭발적기인돌변과정적학정.
