西北师范大学学报（自然科学版）
西北師範大學學報（自然科學版）
서북사범대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF NORTHWEST NORMAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2012年
6期
76-81
,共6页
郭彦岑%尹群健%卓书辉%方再光
郭彥岑%尹群健%卓書輝%方再光
곽언잠%윤군건%탁서휘%방재광
琼胶降解菌%琼胶寡糖%鉴定%16S rDNA
瓊膠降解菌%瓊膠寡糖%鑒定%16S rDNA
경효강해균%경효과당%감정%16S rDNA
从热带海洋中分离出能高效降解琼胶的菌株,并对其分类地位进行鉴定.在改良培养基上分离纯化出以琼胶作为碳源的能高效降解琼胶的细菌,以细菌基因组DNA为模板,设计合成细菌16S rDNA的通用引物,利用PCR技术对16S rDNA目的片段进行克隆,目的片段经过连接、转化和序列测定,测序结果与GenBank数据库收录的16SrDNAs序列进行BLAST比较分析,利用MEGA软件构建系统发育树,确定细菌的分类地位.分离鉴定的三株细菌,分别编号为FG1、FG2和FG3,均为革兰氏阴性菌,其16S rDNAs序列在GenBank中的收录号依次为JX073661、JX073662和JX073663.FG1菌株的16S rDNA与聚团拉布伦茨氏菌(Labrenzia aggregata)16S rDNA序列同源性达到99％;FG2与哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)序列同源性达到99％;FG3与星箭头菌(Sagittula stellata)序列同源性达到97％.初步鉴定FG1与FG3均属于红细菌科(Rhodobacteraceae),FG1为拉布伦茨氏菌属(Labrenzia sp),FG2为弧菌属(Vibrio sp),FG3为箭头菌属(Sagittula sp).
從熱帶海洋中分離齣能高效降解瓊膠的菌株,併對其分類地位進行鑒定.在改良培養基上分離純化齣以瓊膠作為碳源的能高效降解瓊膠的細菌,以細菌基因組DNA為模闆,設計閤成細菌16S rDNA的通用引物,利用PCR技術對16S rDNA目的片段進行剋隆,目的片段經過連接、轉化和序列測定,測序結果與GenBank數據庫收錄的16SrDNAs序列進行BLAST比較分析,利用MEGA軟件構建繫統髮育樹,確定細菌的分類地位.分離鑒定的三株細菌,分彆編號為FG1、FG2和FG3,均為革蘭氏陰性菌,其16S rDNAs序列在GenBank中的收錄號依次為JX073661、JX073662和JX073663.FG1菌株的16S rDNA與聚糰拉佈倫茨氏菌(Labrenzia aggregata)16S rDNA序列同源性達到99％;FG2與哈維氏弧菌(Vibrio harveyi)序列同源性達到99％;FG3與星箭頭菌(Sagittula stellata)序列同源性達到97％.初步鑒定FG1與FG3均屬于紅細菌科(Rhodobacteraceae),FG1為拉佈倫茨氏菌屬(Labrenzia sp),FG2為弧菌屬(Vibrio sp),FG3為箭頭菌屬(Sagittula sp).
종열대해양중분리출능고효강해경효적균주,병대기분류지위진행감정.재개량배양기상분리순화출이경효작위탄원적능고효강해경효적세균,이세균기인조DNA위모판,설계합성세균16S rDNA적통용인물,이용PCR기술대16S rDNA목적편단진행극륭,목적편단경과련접、전화화서렬측정,측서결과여GenBank수거고수록적16SrDNAs서렬진행BLAST비교분석,이용MEGA연건구건계통발육수,학정세균적분류지위.분리감정적삼주세균,분별편호위FG1、FG2화FG3,균위혁란씨음성균,기16S rDNAs서렬재GenBank중적수록호의차위JX073661、JX073662화JX073663.FG1균주적16S rDNA여취단랍포륜자씨균(Labrenzia aggregata)16S rDNA서렬동원성체도99％;FG2여합유씨호균(Vibrio harveyi)서렬동원성체도99％;FG3여성전두균(Sagittula stellata)서렬동원성체도97％.초보감정FG1여FG3균속우홍세균과(Rhodobacteraceae),FG1위랍포륜자씨균속(Labrenzia sp),FG2위호균속(Vibrio sp),FG3위전두균속(Sagittula sp).
