山西大学学报（自然科学版）
山西大學學報（自然科學版）
산서대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHANXI UNIVERSITY
2011年
2期
301-306
,共6页
张理光%王清路%朱雅静%王伟
張理光%王清路%硃雅靜%王偉
장리광%왕청로%주아정%왕위
CHROMO结构域%四膜虫%TCD3基因%RACE%聚类分析
CHROMO結構域%四膜蟲%TCD3基因%RACE%聚類分析
CHROMO결구역%사막충%TCD3기인%RACE%취류분석
含有CHROMO(chromatin organization modifier)结构域的蛋白参与了染色质结构的调节.本研究从嗜热四膜虫(Tetrahymenathermophila)全基因数据库(www.ciliate.org)和基因表达数据库(tged.ihb.ac.cn)中筛选到有性生殖特异表达TCD3(Tetrahymena chromo domain-containing protein 3)基因.该基因ORF为1 005 bp,大核染色体中基因全长l 241 bp,含有两个内含子.5'-RACE和3'-RACE表明5'端非编码区(5'-UTR)长度为40 bp,3'端非编码区(3'-UTR)长度为90 bp.TCD3基因预测编码334个氨基酸构成,含有一个CHROMO结构域.CHROMO结构域聚类分析表明四膜虫Tcd3蛋白可能与线虫CeCDP功能类似,参与异染色质的形成和DNA序列删除.
含有CHROMO(chromatin organization modifier)結構域的蛋白參與瞭染色質結構的調節.本研究從嗜熱四膜蟲(Tetrahymenathermophila)全基因數據庫(www.ciliate.org)和基因錶達數據庫(tged.ihb.ac.cn)中篩選到有性生殖特異錶達TCD3(Tetrahymena chromo domain-containing protein 3)基因.該基因ORF為1 005 bp,大覈染色體中基因全長l 241 bp,含有兩箇內含子.5'-RACE和3'-RACE錶明5'耑非編碼區(5'-UTR)長度為40 bp,3'耑非編碼區(3'-UTR)長度為90 bp.TCD3基因預測編碼334箇氨基痠構成,含有一箇CHROMO結構域.CHROMO結構域聚類分析錶明四膜蟲Tcd3蛋白可能與線蟲CeCDP功能類似,參與異染色質的形成和DNA序列刪除.
함유CHROMO(chromatin organization modifier)결구역적단백삼여료염색질결구적조절.본연구종기열사막충(Tetrahymenathermophila)전기인수거고(www.ciliate.org)화기인표체수거고(tged.ihb.ac.cn)중사선도유성생식특이표체TCD3(Tetrahymena chromo domain-containing protein 3)기인.해기인ORF위1 005 bp,대핵염색체중기인전장l 241 bp,함유량개내함자.5'-RACE화3'-RACE표명5'단비편마구(5'-UTR)장도위40 bp,3'단비편마구(3'-UTR)장도위90 bp.TCD3기인예측편마334개안기산구성,함유일개CHROMO결구역.CHROMO결구역취류분석표명사막충Tcd3단백가능여선충CeCDP공능유사,삼여이염색질적형성화DNA서렬산제.
